52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0297 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  866    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  49.14 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  46.67 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  49.63 
 
 		 446 aa  401  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  40.27 
 
 		 444 aa  335  5.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  42.93 
 
 		 444 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  41.95 
 
 		 454 aa  320  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  38.94 
 
 		 468 aa  316  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  34.74 
 
 		 463 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  35.64 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  34.55 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  33.41 
 
 		 472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4820  O-antigen polymerase  24.67 
 
 		 487 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53889  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  26.42 
 
 		 460 aa  144  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3179  O-antigen polymerase  27.79 
 
 		 453 aa  143  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.579286  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  27.53 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  27.46 
 
 		 464 aa  90.5  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  25.38 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  23.5 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  26.39 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  22.81 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  23.37 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  29.74 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  23.53 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  25.74 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  22.77 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  24.43 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  29.9 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  25.51 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  27.35 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  22.96 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  26.74 
 
 		 446 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  25.53 
 
 		 498 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2640  O-antigen polymerase  33.64 
 
 		 434 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0149794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  25.17 
 
 		 447 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  28.34 
 
 		 540 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  26.7 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0753  O-antigen polymerase  27.59 
 
 		 476 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409596  hitchhiker  0.000594246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  27.04 
 
 		 404 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  27.04 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  24.19 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  25.5 
 
 		 500 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  26.58 
 
 		 504 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  26.9 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  23.66 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  26.9 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  26.9 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  22.32 
 
 		 459 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  24.73 
 
 		 471 aa  43.5  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2726  O-antigen polymerase  32.93 
 
 		 434 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>