More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0695 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0695  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 450 aa  903    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  43.51 
 
 		 454 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  41.7 
 
 		 458 aa  363  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  43.62 
 
 		 448 aa  358  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  43.05 
 
 		 489 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  41.92 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  41.99 
 
 		 458 aa  352  7e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  41.99 
 
 		 458 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  41.99 
 
 		 458 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  40.13 
 
 		 459 aa  351  1e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  41.99 
 
 		 458 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  41.99 
 
 		 458 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  41.99 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  41.99 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  41.99 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  41.99 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  42.79 
 
 		 457 aa  349  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  42.52 
 
 		 453 aa  349  5e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  41.56 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  41.77 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  42.27 
 
 		 455 aa  347  3e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  42.7 
 
 		 453 aa  346  5e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  41.39 
 
 		 446 aa  345  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  42.49 
 
 		 454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  42.49 
 
 		 454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  41.13 
 
 		 461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  40.96 
 
 		 457 aa  343  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  41.63 
 
 		 454 aa  343  4e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  41.41 
 
 		 452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  43.26 
 
 		 484 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  40.65 
 
 		 457 aa  339  7e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  42.56 
 
 		 457 aa  338  8e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  42.83 
 
 		 462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  42.83 
 
 		 462 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  42.02 
 
 		 457 aa  336  5e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  41.58 
 
 		 457 aa  336  5e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  42.43 
 
 		 466 aa  336  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  40.44 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  42.13 
 
 		 453 aa  334  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  39.05 
 
 		 461 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  39.17 
 
 		 470 aa  333  4e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  39.12 
 
 		 451 aa  332  9e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  41.78 
 
 		 453 aa  332  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  39.87 
 
 		 454 aa  332  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  41.55 
 
 		 453 aa  331  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  41.43 
 
 		 448 aa  332  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  42.58 
 
 		 464 aa  330  2e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  41.06 
 
 		 446 aa  330  4e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 449 aa  330  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  41.06 
 
 		 446 aa  330  4e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  44.08 
 
 		 451 aa  329  6e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  41.2 
 
 		 447 aa  328  9e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  44.19 
 
 		 460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  39.39 
 
 		 463 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  40.53 
 
 		 446 aa  327  3e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  41.44 
 
 		 446 aa  327  3e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1854  DNA repair protein RadA  44.29 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  43.49 
 
 		 448 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  40.86 
 
 		 451 aa  326  5e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  40.26 
 
 		 461 aa  326  6e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  42.02 
 
 		 450 aa  326  7e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  42.63 
 
 		 449 aa  326  7e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1332  DNA repair protein RadA  46 
 
 		 453 aa  325  9e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.909582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  43.56 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  45.86 
 
 		 415 aa  324  2e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  40.55 
 
 		 459 aa  322  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  42.79 
 
 		 457 aa  322  9.000000000000001e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  40.55 
 
 		 459 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  44.24 
 
 		 474 aa  321  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1806  DNA repair protein RadA  42.79 
 
 		 453 aa  320  3e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  43.45 
 
 		 463 aa  320  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  38.34 
 
 		 514 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  38.34 
 
 		 514 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  41.14 
 
 		 452 aa  319  6e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  40.65 
 
 		 467 aa  319  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  40.18 
 
 		 450 aa  318  9e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  42.76 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  40.43 
 
 		 464 aa  318  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0406  DNA repair protein RadA  42 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.509389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0525  DNA repair protein RadA  40.37 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  40.69 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  41.76 
 
 		 455 aa  317  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1179  DNA repair protein RadA  40.45 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.595072 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  40.92 
 
 		 449 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  43.25 
 
 		 457 aa  318  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1064  DNA repair protein RadA  43.22 
 
 		 452 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  42.55 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1145  DNA repair protein RadA  43.26 
 
 		 458 aa  317  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  42.53 
 
 		 457 aa  317  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0963  DNA repair protein RadA  39.58 
 
 		 446 aa  316  5e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314277  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0489  DNA repair protein RadA  41.65 
 
 		 457 aa  316  6e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.665667  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  38.8 
 
 		 450 aa  316  6e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  42.76 
 
 		 455 aa  316  6e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  41.53 
 
 		 466 aa  316  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  42.79 
 
 		 466 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  38.58 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5903  DNA repair protein RadA  41.36 
 
 		 460 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04230  hypothetical protein  41.36 
 
 		 460 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4936  DNA repair protein RadA  41.36 
 
 		 460 aa  315  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4938  DNA repair protein RadA  41.36 
 
 		 460 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.664332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>