More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1594 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1594  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 317 aa  662    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1453  dihydrodipicolinate synthetase  68.57 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4403  dihydrodipicolinate synthetase  63.49 
 
 		 318 aa  441  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210844  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3897  dihydrodipicolinate synthetase  24.62 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63489  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4352  dihydrodipicolinate synthetase  30.56 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  24.92 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1696  dihydrodipicolinate synthetase  25.33 
 
 		 325 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1674  dihydrodipicolinate synthetase  25.33 
 
 		 325 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.954641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1724  dihydrodipicolinate synthetase  25.33 
 
 		 325 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1740  dihydrodipicolinate synthetase  25.33 
 
 		 325 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0558  dihydrodipicolinate synthetase  25.33 
 
 		 325 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.6555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0532  dihydrodipicolinate synthetase  25.33 
 
 		 325 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 300 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  26.37 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  25.68 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  25.68 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  25.68 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  26.19 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  25.85 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  25.9 
 
 		 290 aa  92.8  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 299 aa  92.4  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  26.19 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  25.57 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  26.21 
 
 		 294 aa  92.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  27.05 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  25.34 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  27.96 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  25.51 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  26.38 
 
 		 290 aa  89.4  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  24.59 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  23.93 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  25.25 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  25.67 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  24.76 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 		 313 aa  87  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  25.17 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  24.34 
 
 		 293 aa  85.9  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  25.91 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  27.89 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  27.82 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  27.82 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  25.26 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  25.17 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  22.95 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  29.09 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  29.09 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  22.95 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  25.4 
 
 		 293 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  24.01 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  27.39 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  24.83 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  25.4 
 
 		 293 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  27.46 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  24.59 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  27.06 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  25.82 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  24.75 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  27.52 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  25.16 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  24.75 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  26.69 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  25.08 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  24.18 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1603  dihydrodipicolinate synthetase  26.54 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  26.47 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  24.59 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  25 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  23.86 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  24.18 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  23.3 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  23.68 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1917  dihydrodipicolinate synthetase  24.52 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  27.74 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  24.59 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  24.92 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  25.08 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  25.08 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  24.18 
 
 		 300 aa  75.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  24.91 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  23.28 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  25.41 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1689  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  24.17 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  25.81 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  24.67 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  24.74 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  26.56 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.41 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  25.93 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  25.32 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  24.34 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  26.45 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  24.01 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  26.95 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  24.01 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>