69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1002 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1002  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  450  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3011  SNARE associated Golgi protein  37.22 
 
 		 272 aa  145  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140642 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  36.47 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  31.86 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  30.1 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0150  hypothetical protein  32.95 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113557  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0149  hypothetical protein  32.18 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  31.33 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03520  hypothetical protein  31.02 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.130294 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2357  SNARE associated Golgi protein  31.4 
 
 		 241 aa  91.7  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.865891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01370  hypothetical protein  36.54 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.867089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  27.38 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  24.53 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  33.13 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  24.84 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2397  hypothetical protein  30.49 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  25.32 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  25.32 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  25.32 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  25.32 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  25 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  26.32 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  26.32 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  24.5 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  24.15 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  22.39 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  25.85 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  24.68 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12210  hypothetical protein  24.58 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.992528  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  24.52 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1623  hypothetical protein  27.84 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141356  normal  0.0113653 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  24.19 
 
 		 738 aa  49.3  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0971  hypothetical protein  28.46 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.67 
 
 		 713 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  25.34 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  27.17 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  30.77 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  27.49 
 
 		 716 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  22.58 
 
 		 267 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.93 
 
 		 705 aa  45.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  27.06 
 
 		 258 aa  45.4  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  24.64 
 
 		 215 aa  45.4  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  30.94 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  28.24 
 
 		 803 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  28 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  22.17 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  23.86 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  26.72 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.34 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  24.05 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  24.05 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  24.84 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  24.05 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  24.82 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  24.32 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04161  hypothetical protein  29.2 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0548142  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  23.47 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  23.47 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43839  predicted protein  23.97 
 
 		 409 aa  42.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.416143  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1237  SNARE associated Golgi protein  20.51 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  25.15 
 
 		 236 aa  42  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  25.15 
 
 		 236 aa  42  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  25.24 
 
 		 735 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  25.15 
 
 		 236 aa  42  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  28.14 
 
 		 240 aa  41.6  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0914  hypothetical protein  21.39 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>