90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0900 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0900  coenzyme PQQ synthesis protein c, putative  100 
 
 		 236 aa  491  9.999999999999999e-139  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0755189  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2636  coenzyme PQQ synthesis C  40.89 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000230903  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0845  TENA/THI-4 protein  40.18 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0880  coenzyme PQQ synthesis protein C, putative  38.81 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0369  TENA/THI-4 protein  41.97 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0493  coenzyme PQQ synthesis protein C  39.02 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0078  TENA/THI-4 protein  41.9 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0288  TENA/THI-4 domain-containing protein  31.48 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3633  transcriptional activator, TenA family  28.57 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3762  coenzyme PQQ synthesis C  27.47 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4350  TENA/THI-4 domain-containing protein  26.92 
 
 		 243 aa  72  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  26.92 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1825  hypothetical protein  27.32 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.429837  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1801  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  26.2 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0718323  normal  0.890279 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2551  TENA/THI-4 protein  27.62 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1325  TenA/THI-4 protein  26.92 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6173  putative pyrroloquinoline quinone (coenzyme PQQ) biosynthesis protein C  22.62 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4284  putative coenzyme PQQ synthesis protein  26.92 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0229607  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1447  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.39 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00984795  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0079  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.63 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6302  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.58 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0388  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  27.27 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0651674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2177  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  20.61 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.744366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2490  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.46 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2031  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.29 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0792  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  27.54 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1682  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  32.18 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0881  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.41 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0846  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.78 
 
 		 255 aa  52.4  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2096  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.84 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2448  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  27.92 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6510  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.87 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838235  normal  0.029031 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1739  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.67 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.686029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0290  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  26.44 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.939123  normal  0.620425 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2361  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.67 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0403  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.26 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0407  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.26 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2586  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.28 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0193551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0378  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.26 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2621  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.08 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3917  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.29 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01590  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.44 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.700679  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4825  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.26 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.864658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3421  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  26.14 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157933  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1700  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.78 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1770  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.85 
 
 		 362 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.836859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2154  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.85 
 
 		 372 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.113038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.26 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1818  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.85 
 
 		 366 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1084  hypothetical protein  28.1 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4672  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.58 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6166  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.73 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0997558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5990  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.18 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62561  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0511  coenzyme PQQ synthesis protein C  22.58 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4036  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.34 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0517  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  21.85 
 
 		 361 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2454  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  24.69 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.237207  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5899  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.66 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.545322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0859  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.84 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1980  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.93 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5766  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.18 
 
 		 302 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0246  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.15 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00212827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2468  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.27 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.171563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1941  hypothetical protein  28.8 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.022094 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0513  TENA/THI-4 domain protein  24.17 
 
 		 303 aa  45.8  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0452  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.18 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3321  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.33 
 
 		 254 aa  45.4  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.304052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1149  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.57 
 
 		 253 aa  45.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3055  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.83 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1967  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.29 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0099529  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0751  hypothetical protein  28.85 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000281845  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1926  hypothetical protein  23.04 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445782  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0648  coenzyme PQQ synthesis protein C  28.85 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0116842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38800  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.18 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3307  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.18 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0731  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  19.62 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171697  normal  0.030389 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5121  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.71 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3582  hypothetical protein  29.69 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3247  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.71 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0802  putative transcriptional activator TenA  25.52 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15416e-46 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2482  transcriptional activator, TenA family  23.26 
 
 		 222 aa  42.4  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  23.81 
 
 		 220 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  25.52 
 
 		 231 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000639213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  25.52 
 
 		 231 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0691  transcriptional activator TenA  25.52 
 
 		 231 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0725  transcriptional activator TenA  25.52 
 
 		 231 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00338422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0879  putative transcriptional activator TenA  25.52 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00330179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0795  transcriptional activator TenA, putative  25.52 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4549  putative transcriptional activator TenA  25.52 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00503672  normal  0.282706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>