36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0288 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0288  TENA/THI-4 domain-containing protein  100 
 
 
246 aa  509  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2636  coenzyme PQQ synthesis C  34.22 
 
 
247 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000230903  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0845  TENA/THI-4 protein  35.35 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0900  coenzyme PQQ synthesis protein c, putative  31.48 
 
 
236 aa  124  1e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0755189  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0369  TENA/THI-4 protein  37.38 
 
 
234 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_002978  WD0880  coenzyme PQQ synthesis protein C, putative  27.86 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0493  coenzyme PQQ synthesis protein C  28.02 
 
 
232 aa  96.3  4e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0078  TENA/THI-4 protein  28.34 
 
 
226 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3633  transcriptional activator, TenA family  25.71 
 
 
238 aa  59.3  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3762  coenzyme PQQ synthesis C  25.71 
 
 
243 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1825  hypothetical protein  24.65 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.429837  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4350  TENA/THI-4 domain-containing protein  24.47 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1325  TenA/THI-4 protein  20.11 
 
 
239 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4284  putative coenzyme PQQ synthesis protein  23.4 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0229607  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2361  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.18 
 
 
264 aa  48.9  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3307  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.75 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1967  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.81 
 
 
250 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0099529  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38800  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.49 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2551  TENA/THI-4 protein  24.4 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2621  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.3 
 
 
240 aa  45.4  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3740  TENA/THI-4 protein  22.12 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.805522  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0079  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.34 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1173  hypothetical protein  37.04 
 
 
332 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4672  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.64 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4825  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.16 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.864658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1447  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.36 
 
 
241 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00984795  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1682  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.03 
 
 
250 aa  42.7  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.22 
 
 
250 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0403  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.16 
 
 
251 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0511  coenzyme PQQ synthesis protein C  22.64 
 
 
251 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0407  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.16 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0378  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.16 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5766  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.58 
 
 
302 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3917  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.94 
 
 
256 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0648  coenzyme PQQ synthesis protein C  23.03 
 
 
253 aa  42  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0116842  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0751  hypothetical protein  23.03 
 
 
253 aa  42  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000281845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>