17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6173 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6173  putative pyrroloquinoline quinone (coenzyme PQQ) biosynthesis protein C  100 
 
 		 237 aa  495  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1999  hypothetical protein  42.74 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.436839 
 
 
-
 
NC_002978  WD0880  coenzyme PQQ synthesis protein C, putative  27.03 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1084  hypothetical protein  28.87 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2551  TENA/THI-4 protein  28.82 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2636  coenzyme PQQ synthesis C  24.8 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000230903  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0900  coenzyme PQQ synthesis protein c, putative  22.62 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0755189  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1325  TenA/THI-4 protein  23.53 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3633  transcriptional activator, TenA family  22.37 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3762  coenzyme PQQ synthesis C  23.87 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1825  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.429837  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0845  TENA/THI-4 protein  24.78 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4350  TENA/THI-4 domain-containing protein  23.18 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4484  hypothetical protein  26.32 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00575603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4284  putative coenzyme PQQ synthesis protein  22.5 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0229607  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0493  coenzyme PQQ synthesis protein C  23.29 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0369  TENA/THI-4 protein  27.91 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.882306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>