26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4284 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4284  putative coenzyme PQQ synthesis protein  100 
 
 		 254 aa  532  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0229607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1325  TenA/THI-4 protein  83.05 
 
 		 239 aa  423  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3762  coenzyme PQQ synthesis C  67.52 
 
 		 243 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1825  hypothetical protein  67.95 
 
 		 243 aa  322  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.429837  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3633  transcriptional activator, TenA family  68.7 
 
 		 238 aa  321  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4350  TENA/THI-4 domain-containing protein  65.81 
 
 		 243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0880  coenzyme PQQ synthesis protein C, putative  27.35 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2636  coenzyme PQQ synthesis C  27 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000230903  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0845  TENA/THI-4 protein  26.83 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0369  TENA/THI-4 protein  25.89 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0078  TENA/THI-4 protein  30.06 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2154  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.77 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.113038 
 
 
-
 
NC_002620  TC0900  coenzyme PQQ synthesis protein c, putative  26.92 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0755189  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1818  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.77 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1770  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.95 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.836859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5990  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.31 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0517  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  23.74 
 
 		 361 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5766  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.46 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0493  coenzyme PQQ synthesis protein C  23.84 
 
 		 232 aa  49.7  0.00005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0288  TENA/THI-4 domain-containing protein  23.4 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1999  hypothetical protein  22.63 
 
 		 240 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.436839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6173  putative pyrroloquinoline quinone (coenzyme PQQ) biosynthesis protein C  22.5 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0079  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.86 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1700  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.14 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1447  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.62 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00984795  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4036  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.2 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>