64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2636 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2636  coenzyme PQQ synthesis C  100 
 
 		 247 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000230903  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0880  coenzyme PQQ synthesis protein C, putative  42.6 
 
 		 219 aa  184  9e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0900  coenzyme PQQ synthesis protein c, putative  40.89 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0755189  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0845  TENA/THI-4 protein  40.97 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0369  TENA/THI-4 protein  39.91 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0493  coenzyme PQQ synthesis protein C  40.28 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0288  TENA/THI-4 domain-containing protein  34.22 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0078  TENA/THI-4 protein  38.74 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1325  TenA/THI-4 protein  27.12 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3762  coenzyme PQQ synthesis C  27.12 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3633  transcriptional activator, TenA family  28.05 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4284  putative coenzyme PQQ synthesis protein  27 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0229607  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4350  TENA/THI-4 domain-containing protein  26.27 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2551  TENA/THI-4 protein  28.5 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1999  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.436839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1825  hypothetical protein  27.6 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.429837  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6173  putative pyrroloquinoline quinone (coenzyme PQQ) biosynthesis protein C  24.8 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0079  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.52 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.39 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4672  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.39 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0511  coenzyme PQQ synthesis protein C  23.39 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2454  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  22.22 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.237207  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0407  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.94 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0378  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.74 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0403  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.74 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  26.49 
 
 		 524 aa  50.1  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3307  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.94 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3247  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.43 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5160  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.43 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.666649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4825  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.48 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.864658 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5121  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.43 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2177  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  22.75 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.744366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2586  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0193551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38800  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.71 
 
 		 250 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1967  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.83 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0099529  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41660  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.66 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177841  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5967  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.68 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.614403  normal  0.0196017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18810  hypothetical protein  25.52 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0660797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1770  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.13 
 
 		 362 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.836859 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2096  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.42 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3917  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.37 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1628  hypothetical protein  25.63 
 
 		 380 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2154  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.13 
 
 		 372 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.113038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2361  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.1 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1818  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.27 
 
 		 366 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0246  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.07 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00212827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2490  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.42 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5766  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.09 
 
 		 302 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5899  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.35 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.545322 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01590  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.3 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.700679  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0388  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.28 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0651674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0517  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  23.61 
 
 		 361 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5990  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.94 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62561  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6166  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.35 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0997558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1739  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.94 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.686029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1700  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  19.83 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1801  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.61 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0718323  normal  0.890279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4036  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  19.92 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1682  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.65 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.993196 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0513  TENA/THI-4 domain protein  25.11 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1447  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.88 
 
 		 241 aa  42  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00984795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6302  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.72 
 
 		 251 aa  42  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1926  hypothetical protein  23.01 
 
 		 236 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445782  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0452  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.38 
 
 		 250 aa  42  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>