74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0880 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0880  coenzyme PQQ synthesis protein C, putative  100 
 
 
219 aa  458  9.999999999999999e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0493  coenzyme PQQ synthesis protein C  47.29 
 
 
232 aa  211  7e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0845  TENA/THI-4 protein  48.13 
 
 
234 aa  187  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2636  coenzyme PQQ synthesis C  42.6 
 
 
247 aa  184  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000230903  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0369  TENA/THI-4 protein  50.85 
 
 
234 aa  176  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_002620  TC0900  coenzyme PQQ synthesis protein c, putative  38.81 
 
 
236 aa  170  1e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0755189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0078  TENA/THI-4 protein  34.29 
 
 
226 aa  131  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0288  TENA/THI-4 domain-containing protein  27.86 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4284  putative coenzyme PQQ synthesis protein  27.35 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0229607  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3633  transcriptional activator, TenA family  28.5 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3762  coenzyme PQQ synthesis C  28.57 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6173  putative pyrroloquinoline quinone (coenzyme PQQ) biosynthesis protein C  27.03 
 
 
237 aa  79  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4350  TENA/THI-4 domain-containing protein  28.31 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1825  hypothetical protein  27.1 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.429837  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1325  TenA/THI-4 protein  24.55 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2551  TENA/THI-4 protein  25 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1999  hypothetical protein  27.48 
 
 
240 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.436839 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  26.36 
 
 
524 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38800  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.46 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3307  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.46 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2454  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  22.17 
 
 
232 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.237207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3055  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.89 
 
 
254 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5899  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.09 
 
 
239 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2177  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  21.68 
 
 
230 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.744366  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1700  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.86 
 
 
231 aa  55.1  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6166  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.51 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0997558  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3917  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.11 
 
 
256 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1801  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0718323  normal  0.890279 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2468  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.98 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.171563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.55 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1967  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21 
 
 
250 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0099529  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0859  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  19.05 
 
 
251 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0648  coenzyme PQQ synthesis protein C  25 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0116842  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0751  hypothetical protein  25 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000281845  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0511  coenzyme PQQ synthesis protein C  20.55 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4825  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  19.63 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.864658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0290  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.89 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.939123  normal  0.620425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0407  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  19.63 
 
 
251 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2251  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  19.46 
 
 
249 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0378  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  19.63 
 
 
251 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0403  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  19.63 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5160  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.88 
 
 
239 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.666649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4672  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.09 
 
 
251 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3247  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.43 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5967  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.16 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.614403  normal  0.0196017 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5121  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.43 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0246  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.7 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00212827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4036  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.48 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368072  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1447  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.36 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00984795  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1770  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.12 
 
 
362 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.836859 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2096  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.89 
 
 
236 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49419  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0079  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.46 
 
 
246 aa  48.9  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1980  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.33 
 
 
249 aa  48.9  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2490  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.89 
 
 
236 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6510  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  19.64 
 
 
235 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838235  normal  0.029031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.39 
 
 
743 aa  48.1  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1780  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.35 
 
 
230 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612673  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2586  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.3 
 
 
243 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0193551  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0452  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.88 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2154  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.12 
 
 
372 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.113038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1818  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.84 
 
 
366 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5766  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.84 
 
 
302 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5990  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.18 
 
 
266 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62561  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2361  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.8 
 
 
264 aa  45.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.7 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3442  hypothetical protein  19.31 
 
 
241 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0233044 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0323  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.44 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0541289  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0881  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.9 
 
 
258 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2031  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.38 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6302  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.57 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3421  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.7 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157933  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0987  TENA/THI-4 domain-containing protein  24.85 
 
 
291 aa  42.7  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121983  normal  0.113614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0846  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  19.91 
 
 
255 aa  42  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0731  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  18.7 
 
 
243 aa  41.6  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171697  normal  0.030389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>