21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2551 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2551  TENA/THI-4 protein  100 
 
 
243 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1926  hypothetical protein  29.22 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445782  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2636  coenzyme PQQ synthesis C  28.5 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000230903  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0880  coenzyme PQQ synthesis protein C, putative  25 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0845  TENA/THI-4 protein  23.66 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6173  putative pyrroloquinoline quinone (coenzyme PQQ) biosynthesis protein C  28.82 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0751  hypothetical protein  24.26 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000281845  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0648  coenzyme PQQ synthesis protein C  24.26 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0116842  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0900  coenzyme PQQ synthesis protein c, putative  27.62 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0755189  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0493  coenzyme PQQ synthesis protein C  26.09 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3487  hypothetical protein  26.11 
 
 
364 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1629  hypothetical protein  29.55 
 
 
328 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18820  hypothetical protein  28.98 
 
 
328 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0660797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0369  TENA/THI-4 protein  23.21 
 
 
234 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  22.51 
 
 
524 aa  48.9  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1287  hypothetical protein  33.74 
 
 
378 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143964  normal  0.0342007 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0288  TENA/THI-4 domain-containing protein  24.4 
 
 
246 aa  46.2  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2183  hypothetical protein  25.95 
 
 
241 aa  45.4  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.141481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2070  hypothetical protein  32.93 
 
 
347 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1999  hypothetical protein  22.77 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.436839 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18920  hypothetical protein  28.95 
 
 
299 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.620455  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>