32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18920 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_18920  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  593  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.620455  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3588  hypothetical protein  46.03 
 
 
351 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3393  hypothetical protein  46.23 
 
 
336 aa  215  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0465  hypothetical protein  43.1 
 
 
355 aa  190  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399016  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13100  hypothetical protein  42.47 
 
 
360 aa  186  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2109  hypothetical protein  41.58 
 
 
338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2070  hypothetical protein  41.11 
 
 
347 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3964  hypothetical protein  41.1 
 
 
322 aa  172  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0643  hypothetical protein  40.14 
 
 
356 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3469  hypothetical protein  37.33 
 
 
333 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3358  hypothetical protein  37.5 
 
 
337 aa  148  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2309  hypothetical protein  33.79 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00941536  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1041  hypothetical protein  34.81 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2449  hypothetical protein  35.84 
 
 
356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000884224  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4851  hypothetical protein  35.19 
 
 
343 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868118  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4939  hypothetical protein  35.19 
 
 
343 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5218  hypothetical protein  35.19 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5789  hypothetical protein  33.79 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.856799  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11420  hypothetical protein  33.91 
 
 
362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4297  hypothetical protein  34.39 
 
 
331 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6635  hypothetical protein  31.77 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1617  hypothetical protein  28.97 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3868  hypothetical protein  27.98 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312914  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4621  hypothetical protein  27.47 
 
 
368 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2773  hypothetical protein  30.13 
 
 
357 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0574  hypothetical protein  27.62 
 
 
367 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2434  hypothetical protein  25.53 
 
 
464 aa  58.9  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3487  hypothetical protein  31.88 
 
 
364 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0911  hypothetical protein  28.35 
 
 
291 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0745  cupin 2 protein  23.27 
 
 
477 aa  46.2  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0775  hypothetical protein  26.5 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2551  TENA/THI-4 protein  28.95 
 
 
243 aa  42.7  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>