18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3868 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3868  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312914  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1617  hypothetical protein  91.23 
 
 		 285 aa  540  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0574  hypothetical protein  24.17 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18920  hypothetical protein  27.98 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.620455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2773  hypothetical protein  27.27 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4621  hypothetical protein  23.24 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220381 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2434  hypothetical protein  25.12 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3588  hypothetical protein  24.31 
 
 		 351 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13100  hypothetical protein  24.47 
 
 		 360 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2449  hypothetical protein  26.85 
 
 		 356 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000884224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2109  hypothetical protein  22.84 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3469  hypothetical protein  24.48 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11420  hypothetical protein  27.52 
 
 		 362 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1041  hypothetical protein  24.15 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3700  hypothetical protein  27.23 
 
 		 363 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3487  hypothetical protein  23.26 
 
 		 364 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0465  hypothetical protein  21.3 
 
 		 355 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5789  hypothetical protein  25.45 
 
 		 336 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.856799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>