31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13100 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13100  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  717    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0465  hypothetical protein  62.61 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3588  hypothetical protein  59.89 
 
 		 351 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2070  hypothetical protein  54.94 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2109  hypothetical protein  50 
 
 		 338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3393  hypothetical protein  48.69 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0643  hypothetical protein  47.21 
 
 		 356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2449  hypothetical protein  44.28 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000884224  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6635  hypothetical protein  45.03 
 
 		 337 aa  252  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3964  hypothetical protein  44.38 
 
 		 322 aa  249  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1041  hypothetical protein  41.69 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3469  hypothetical protein  43.1 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5789  hypothetical protein  41.18 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.856799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11420  hypothetical protein  40.94 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5218  hypothetical protein  42.11 
 
 		 343 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999482 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3358  hypothetical protein  42.15 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4939  hypothetical protein  41.81 
 
 		 343 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4851  hypothetical protein  41.81 
 
 		 343 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868118  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4297  hypothetical protein  41.11 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2309  hypothetical protein  39.82 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00941536  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18920  hypothetical protein  42.25 
 
 		 299 aa  182  9.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.620455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2773  hypothetical protein  28.15 
 
 		 357 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2434  hypothetical protein  27.47 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0574  hypothetical protein  26.81 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4621  hypothetical protein  25.51 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220381 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3487  hypothetical protein  24.42 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0775  hypothetical protein  28.17 
 
 		 352 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1617  hypothetical protein  24.02 
 
 		 285 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0745  cupin 2 protein  25.74 
 
 		 477 aa  50.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3868  hypothetical protein  24.47 
 
 		 285 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312914  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3925  hypothetical protein  24.03 
 
 		 310 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>