33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2309 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2309  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  667    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00941536  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11420  hypothetical protein  58.94 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2449  hypothetical protein  60.87 
 
 		 356 aa  362  6e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000884224  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1041  hypothetical protein  56.33 
 
 		 338 aa  348  7e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3469  hypothetical protein  56.01 
 
 		 333 aa  338  8e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5789  hypothetical protein  54.08 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.856799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4939  hypothetical protein  54.63 
 
 		 343 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4851  hypothetical protein  54.63 
 
 		 343 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868118  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5218  hypothetical protein  54.63 
 
 		 343 aa  331  9e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999482 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3358  hypothetical protein  55.31 
 
 		 337 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6635  hypothetical protein  53.77 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4297  hypothetical protein  53.85 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3393  hypothetical protein  44.62 
 
 		 336 aa  255  8e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2070  hypothetical protein  45.54 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0643  hypothetical protein  45.37 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2109  hypothetical protein  42.15 
 
 		 338 aa  225  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3964  hypothetical protein  42.22 
 
 		 322 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3588  hypothetical protein  43.34 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0465  hypothetical protein  40 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13100  hypothetical protein  39.82 
 
 		 360 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18920  hypothetical protein  34.39 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.620455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0775  hypothetical protein  27.41 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4621  hypothetical protein  26.22 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220381 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2434  hypothetical protein  24.4 
 
 		 464 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2773  hypothetical protein  23.21 
 
 		 357 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0574  hypothetical protein  25 
 
 		 367 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3925  hypothetical protein  25.34 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111688 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0071  hypothetical protein  21.86 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3700  hypothetical protein  24.06 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4825  hypothetical protein  24.81 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.923521  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0745  cupin 2 protein  22.16 
 
 		 477 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3487  hypothetical protein  24.05 
 
 		 364 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1617  hypothetical protein  25.17 
 
 		 285 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.379725 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>