25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3700 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3700  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  743    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3487  hypothetical protein  30.84 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3925  hypothetical protein  33.1 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0911  hypothetical protein  33.47 
 
 		 291 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0071  hypothetical protein  26.47 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4825  hypothetical protein  30.3 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.923521  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4621  hypothetical protein  25.34 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2070  hypothetical protein  29.07 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3469  hypothetical protein  29.79 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0574  hypothetical protein  27.2 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5218  hypothetical protein  24.77 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4939  hypothetical protein  24.77 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4851  hypothetical protein  24.77 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868118  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5789  hypothetical protein  28.03 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.856799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1287  hypothetical protein  29.17 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143964  normal  0.0342007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2449  hypothetical protein  24.22 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000884224  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1041  hypothetical protein  27.82 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1617  hypothetical protein  27.88 
 
 		 285 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3358  hypothetical protein  28.37 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2309  hypothetical protein  24.06 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00941536  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2773  hypothetical protein  24 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2109  hypothetical protein  25 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0643  hypothetical protein  24.32 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3868  hypothetical protein  27.23 
 
 		 285 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312914  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3964  hypothetical protein  24.05 
 
 		 322 aa  43.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>