29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11420 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11420  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  734    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2449  hypothetical protein  64.55 
 
 		 356 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000884224  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1041  hypothetical protein  59.34 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5789  hypothetical protein  59.15 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.856799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2309  hypothetical protein  58.94 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00941536  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4851  hypothetical protein  58.13 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868118  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4939  hypothetical protein  58.13 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5218  hypothetical protein  58.13 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4297  hypothetical protein  51.49 
 
 		 331 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3358  hypothetical protein  53.61 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3469  hypothetical protein  53.73 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6635  hypothetical protein  48.62 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2109  hypothetical protein  45.12 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2070  hypothetical protein  45.45 
 
 		 347 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3393  hypothetical protein  43.58 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3588  hypothetical protein  42.03 
 
 		 351 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0465  hypothetical protein  40.23 
 
 		 355 aa  233  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13100  hypothetical protein  40.94 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3964  hypothetical protein  43.34 
 
 		 322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0643  hypothetical protein  39.83 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18920  hypothetical protein  33.45 
 
 		 299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.620455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0775  hypothetical protein  27.81 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4621  hypothetical protein  24.15 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1617  hypothetical protein  26.94 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0574  hypothetical protein  23 
 
 		 367 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3868  hypothetical protein  27.52 
 
 		 285 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312914  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2434  hypothetical protein  22.02 
 
 		 464 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4825  hypothetical protein  24.05 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.923521  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2773  hypothetical protein  22.61 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>