27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2434 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2434  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  952    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0745  cupin 2 protein  39.64 
 
 
477 aa  313  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0775  hypothetical protein  33.65 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2773  hypothetical protein  25.19 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0574  hypothetical protein  26.29 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4621  hypothetical protein  25.41 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1041  hypothetical protein  24.4 
 
 
338 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5789  hypothetical protein  25.58 
 
 
336 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.856799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6635  hypothetical protein  26.19 
 
 
337 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13100  hypothetical protein  27.47 
 
 
360 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3469  hypothetical protein  27.11 
 
 
333 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18920  hypothetical protein  25.53 
 
 
299 aa  58.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.620455  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1617  hypothetical protein  24.5 
 
 
285 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0643  hypothetical protein  25.93 
 
 
356 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3588  hypothetical protein  27.16 
 
 
351 aa  56.6  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3868  hypothetical protein  25.12 
 
 
285 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312914  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2309  hypothetical protein  24.4 
 
 
338 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00941536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2109  hypothetical protein  24.84 
 
 
338 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0465  hypothetical protein  26.71 
 
 
355 aa  53.5  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399016  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2070  hypothetical protein  23.08 
 
 
347 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3393  hypothetical protein  23.84 
 
 
336 aa  50.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4297  hypothetical protein  24.16 
 
 
331 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5218  hypothetical protein  24.42 
 
 
343 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4939  hypothetical protein  24.42 
 
 
343 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4851  hypothetical protein  24.42 
 
 
343 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868118  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11420  hypothetical protein  22.02 
 
 
362 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2449  hypothetical protein  24.42 
 
 
356 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000884224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>