48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0078 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0078  TENA/THI-4 protein  100 
 
 		 226 aa  463  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0900  coenzyme PQQ synthesis protein c, putative  37.79 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0755189  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0845  TENA/THI-4 protein  36.53 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0880  coenzyme PQQ synthesis protein C, putative  34.29 
 
 		 219 aa  138  4.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2636  coenzyme PQQ synthesis C  38.74 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000230903  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0369  TENA/THI-4 protein  36.51 
 
 		 234 aa  134  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0493  coenzyme PQQ synthesis protein C  36.41 
 
 		 232 aa  134  8e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0288  TENA/THI-4 domain-containing protein  28.04 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3633  transcriptional activator, TenA family  30.21 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3762  coenzyme PQQ synthesis C  29.17 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4350  TENA/THI-4 domain-containing protein  29.38 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1825  hypothetical protein  30.63 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.429837  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1325  TenA/THI-4 protein  27.67 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4284  putative coenzyme PQQ synthesis protein  30.06 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0229607  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0079  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  26.96 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0517  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  25.25 
 
 		 361 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1770  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.88 
 
 		 362 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.836859 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0751  hypothetical protein  22.96 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000281845  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0648  coenzyme PQQ synthesis protein C  22.96 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0116842  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2154  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.39 
 
 		 372 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.113038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1818  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.39 
 
 		 366 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5766  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.26 
 
 		 302 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5990  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.75 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62561  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  26.09 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1447  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  26.64 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00984795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6302  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.38 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  24.48 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1801  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.74 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0718323  normal  0.890279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0881  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.26 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2361  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.88 
 
 		 264 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0452  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.14 
 
 		 250 aa  45.8  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2031  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.76 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.48 
 
 		 250 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.41 
 
 		 254 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0846  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.38 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0378  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.52 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0407  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.52 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0403  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.52 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3917  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.87 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3421  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.77 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157933  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4825  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.79 
 
 		 251 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.864658 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  23.37 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4672  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.04 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  21.15 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0511  coenzyme PQQ synthesis protein C  24.04 
 
 		 251 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2551  TENA/THI-4 protein  23.89 
 
 		 243 aa  42  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  23.67 
 
 		 223 aa  42  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  23.6 
 
 		 524 aa  41.6  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>