47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1825 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1825  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  507  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.429837  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3762  coenzyme PQQ synthesis C  89.3 
 
 		 243 aa  461  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4350  TENA/THI-4 domain-containing protein  87.24 
 
 		 243 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3633  transcriptional activator, TenA family  90.91 
 
 		 238 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4284  putative coenzyme PQQ synthesis protein  67.95 
 
 		 254 aa  337  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0229607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1325  TenA/THI-4 protein  66.67 
 
 		 239 aa  331  6e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0369  TENA/THI-4 protein  31.89 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0078  TENA/THI-4 protein  31.87 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0880  coenzyme PQQ synthesis protein C, putative  28.04 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0845  TENA/THI-4 protein  28.05 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2636  coenzyme PQQ synthesis C  27.6 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000230903  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0900  coenzyme PQQ synthesis protein c, putative  27.32 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0755189  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0493  coenzyme PQQ synthesis protein C  26.11 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0288  TENA/THI-4 domain-containing protein  24.65 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6173  putative pyrroloquinoline quinone (coenzyme PQQ) biosynthesis protein C  25.68 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5766  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.94 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2154  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.18 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.113038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1818  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.18 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1770  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.18 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.836859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6302  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.5 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5990  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.98 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62561  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1739  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.32 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.686029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0517  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  24.18 
 
 		 361 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1999  hypothetical protein  27.88 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.436839 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1447  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.9 
 
 		 241 aa  52  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00984795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1801  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.79 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0718323  normal  0.890279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.61 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3307  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.77 
 
 		 270 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38800  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.46 
 
 		 250 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6510  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.26 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838235  normal  0.029031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2031  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.82 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0881  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.85 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1084  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3917  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  26.96 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1980  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.75 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0079  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.97 
 
 		 246 aa  45.4  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3055  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.74 
 
 		 254 aa  45.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2468  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.08 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.171563 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0388  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.84 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0651674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3247  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.72 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5121  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  23.72 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2448  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.3 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0846  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.36 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0511  coenzyme PQQ synthesis protein C  23.3 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2177  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  24.4 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.744366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4672  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.82 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0792  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.87 
 
 		 255 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>