69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2031 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2031  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  100 
 
 		 251 aa  517  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3421  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  94.82 
 
 		 251 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157933  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  92.8 
 
 		 254 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0881  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  88.84 
 
 		 258 aa  470  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6302  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  81.67 
 
 		 251 aa  438  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0792  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  78.78 
 
 		 255 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2448  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  78.37 
 
 		 255 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0388  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  77.96 
 
 		 255 aa  407  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0651674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5990  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  65.56 
 
 		 266 aa  325  6e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1770  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  65.56 
 
 		 362 aa  322  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.836859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1818  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  64.32 
 
 		 366 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2154  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  64.32 
 
 		 372 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.113038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5766  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  64.61 
 
 		 302 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1801  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  67.37 
 
 		 266 aa  319  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0718323  normal  0.890279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0517  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  63.49 
 
 		 361 aa  317  9e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0079  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  67.8 
 
 		 246 aa  317  9e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0846  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  65.81 
 
 		 255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1980  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  67.37 
 
 		 249 aa  311  9e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3321  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  63.33 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.304052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1739  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  64.02 
 
 		 252 aa  308  4e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.686029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1149  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  62.96 
 
 		 253 aa  305  6e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01590  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  60 
 
 		 250 aa  289  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.700679  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0452  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  57.5 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0691  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  58.72 
 
 		 283 aa  280  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.363937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2361  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  55.74 
 
 		 264 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3917  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  58.33 
 
 		 256 aa  270  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1967  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  49.09 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0099529  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4036  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  46.58 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4825  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  45.34 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.864658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2454  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  47.11 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.237207  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5967  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  46.49 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.614403  normal  0.0196017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0403  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  45.74 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0511  coenzyme PQQ synthesis protein C  45.37 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0407  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  45.74 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0378  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  45.74 
 
 		 251 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4672  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44.93 
 
 		 251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  45.74 
 
 		 250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2177  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  46.33 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.744366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38800  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  46.36 
 
 		 250 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3307  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  46.36 
 
 		 270 aa  194  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5899  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44.49 
 
 		 239 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.545322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6166  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44.49 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0997558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3247  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.17 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2096  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.95 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5121  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.17 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2490  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.95 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2251  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.11 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5160  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.17 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.666649 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1447  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  41.92 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00984795  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2621  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  42.36 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6510  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  41.88 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838235  normal  0.029031 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1682  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.64 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3055  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44.05 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0290  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  42.99 
 
 		 237 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.939123  normal  0.620425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1700  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.18 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0246  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.95 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00212827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1780  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  42.47 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612673  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0859  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  39.41 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2468  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  40.72 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.171563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41660  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  45.74 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177841  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0323  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  41.48 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0541289  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2586  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  41.92 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0193551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0731  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  37.97 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171697  normal  0.030389 
 
 
-
 
NC_002620  TC0900  coenzyme PQQ synthesis protein c, putative  25.29 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0755189  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3762  coenzyme PQQ synthesis C  21.19 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3633  transcriptional activator, TenA family  19.83 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0078  TENA/THI-4 protein  23.76 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0880  coenzyme PQQ synthesis protein C, putative  22.38 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1825  hypothetical protein  20 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.429837  normal  0.202092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>