69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0846 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0846  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  100 
 
 
255 aa  520  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0079  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  69.87 
 
 
246 aa  352  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5990  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  67.23 
 
 
266 aa  340  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62561  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1818  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  66.81 
 
 
366 aa  338  4e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2154  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  66.81 
 
 
372 aa  338  7e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.113038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1770  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  64.75 
 
 
362 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.836859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0517  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  65.11 
 
 
361 aa  334  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5766  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  65.53 
 
 
302 aa  330  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1980  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  68.88 
 
 
249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0792  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  65.04 
 
 
255 aa  315  4e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2448  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  65.04 
 
 
255 aa  314  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01590  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  65.13 
 
 
250 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.700679  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2031  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  65.81 
 
 
251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6302  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  65.38 
 
 
251 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3421  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  65.38 
 
 
251 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157933  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0881  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  63.22 
 
 
258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  64.1 
 
 
254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0388  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  65.38 
 
 
255 aa  305  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0651674  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3321  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  62.13 
 
 
254 aa  295  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.304052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1149  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  62.98 
 
 
253 aa  292  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1801  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  59.07 
 
 
266 aa  281  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0718323  normal  0.890279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1739  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  55.69 
 
 
252 aa  280  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.686029 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0691  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  54.13 
 
 
283 aa  277  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.363937  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3917  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  55.6 
 
 
256 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0452  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  51.27 
 
 
250 aa  258  6e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2361  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  49.16 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1447  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  45.54 
 
 
241 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00984795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2454  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  47.77 
 
 
232 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.237207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2177  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  46.4 
 
 
230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.744366  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6510  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44.93 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838235  normal  0.029031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4036  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44.29 
 
 
244 aa  195  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368072  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5967  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44.44 
 
 
239 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.614403  normal  0.0196017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2096  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44 
 
 
236 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49419  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2621  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.75 
 
 
240 aa  192  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1967  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  45.33 
 
 
250 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0099529  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2490  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44 
 
 
236 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5899  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44 
 
 
239 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545322 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5121  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.05 
 
 
239 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6166  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44 
 
 
239 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0997558  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3247  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.05 
 
 
239 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5160  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.05 
 
 
239 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.666649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38800  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44.44 
 
 
250 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2468  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  41.33 
 
 
250 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.171563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3307  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44 
 
 
270 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1700  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  41.3 
 
 
231 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0246  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  42.67 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00212827 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1682  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  42.99 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1780  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.84 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612673  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0290  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  40.85 
 
 
237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.939123  normal  0.620425 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2251  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  41.23 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0511  coenzyme PQQ synthesis protein C  43.11 
 
 
251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  42.86 
 
 
250 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4672  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.11 
 
 
251 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3055  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  41.2 
 
 
254 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4825  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  41.81 
 
 
251 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.864658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0378  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  41.52 
 
 
251 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0403  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  41.52 
 
 
251 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0407  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  41.52 
 
 
251 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2586  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  42.29 
 
 
243 aa  175  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0193551  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0859  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  38.7 
 
 
251 aa  171  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0323  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  42.17 
 
 
255 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0541289  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41660  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.56 
 
 
250 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177841  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0731  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  37.83 
 
 
243 aa  158  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171697  normal  0.030389 
 
 
-
 
NC_002620  TC0900  coenzyme PQQ synthesis protein c, putative  23.78 
 
 
236 aa  52.4  0.000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0755189  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0369  TENA/THI-4 protein  24.29 
 
 
234 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3762  coenzyme PQQ synthesis C  22.65 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0845  TENA/THI-4 protein  23.73 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3633  transcriptional activator, TenA family  23.61 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0880  coenzyme PQQ synthesis protein C, putative  19.91 
 
 
219 aa  42  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>