30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1325 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1325  TenA/THI-4 protein  100 
 
 
239 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4284  putative coenzyme PQQ synthesis protein  83.05 
 
 
254 aa  423  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0229607  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3762  coenzyme PQQ synthesis C  66.67 
 
 
243 aa  340  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4350  TENA/THI-4 domain-containing protein  68.38 
 
 
243 aa  323  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3633  transcriptional activator, TenA family  67.65 
 
 
238 aa  322  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1825  hypothetical protein  66.67 
 
 
243 aa  314  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.429837  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2636  coenzyme PQQ synthesis C  27.12 
 
 
247 aa  86.3  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000230903  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0880  coenzyme PQQ synthesis protein C, putative  24.55 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0845  TENA/THI-4 protein  23.42 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0078  TENA/THI-4 protein  27.67 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0369  TENA/THI-4 protein  24.86 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_002620  TC0900  coenzyme PQQ synthesis protein c, putative  26.92 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0755189  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1999  hypothetical protein  24.58 
 
 
240 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.436839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6173  putative pyrroloquinoline quinone (coenzyme PQQ) biosynthesis protein C  23.53 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2154  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.31 
 
 
372 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.113038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1818  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.31 
 
 
366 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1447  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.63 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00984795  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5990  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.82 
 
 
266 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62561  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0493  coenzyme PQQ synthesis protein C  20.83 
 
 
232 aa  52.8  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0288  TENA/THI-4 domain-containing protein  20.11 
 
 
246 aa  52  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1770  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.49 
 
 
362 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.836859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0517  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  20.68 
 
 
361 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5766  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.1 
 
 
302 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1700  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  24.1 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0079  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.41 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4036  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  22.71 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368072  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1739  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.67 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.686029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1084  hypothetical protein  24.24 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3055  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  21.65 
 
 
254 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1980  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  20.75 
 
 
249 aa  42.7  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>