20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3582 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3582  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  578  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144348  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4657  hypothetical protein  58.3 
 
 
260 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53120  hypothetical protein  57.03 
 
 
260 aa  308  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4085  hypothetical protein  55.51 
 
 
264 aa  301  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3952  hypothetical protein  53.39 
 
 
271 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0117815  decreased coverage  0.00400212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1738  hypothetical protein  51.75 
 
 
261 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1762  hypothetical protein  54.29 
 
 
261 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3654  hypothetical protein  53.44 
 
 
260 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1353  hypothetical protein  53.88 
 
 
261 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.788281  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1384  hypothetical protein  52.89 
 
 
246 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3251  hypothetical protein  52.89 
 
 
246 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3136  hypothetical protein  52.89 
 
 
246 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2369  hypothetical protein  52.89 
 
 
246 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2077  hypothetical protein  52.89 
 
 
246 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1369  hypothetical protein  51.84 
 
 
261 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1105  hypothetical protein  52.54 
 
 
236 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1465  hypothetical protein  52.99 
 
 
235 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1941  hypothetical protein  53.59 
 
 
246 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.022094 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2337  hypothetical protein  53.31 
 
 
246 aa  262  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0900  coenzyme PQQ synthesis protein c, putative  29.69 
 
 
236 aa  42.7  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0755189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>