19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1738 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1738  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3654  hypothetical protein  94.23 
 
 		 260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4085  hypothetical protein  78.33 
 
 		 264 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4657  hypothetical protein  70.77 
 
 		 260 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53120  hypothetical protein  71.54 
 
 		 260 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1762  hypothetical protein  69.26 
 
 		 261 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1353  hypothetical protein  69.26 
 
 		 261 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.788281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3952  hypothetical protein  68.87 
 
 		 271 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0117815  decreased coverage  0.00400212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1369  hypothetical protein  68.24 
 
 		 261 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3582  hypothetical protein  51.75 
 
 		 278 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1384  hypothetical protein  46.89 
 
 		 246 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3251  hypothetical protein  46.89 
 
 		 246 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3136  hypothetical protein  46.89 
 
 		 246 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2369  hypothetical protein  46.89 
 
 		 246 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2077  hypothetical protein  46.89 
 
 		 246 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1105  hypothetical protein  46.15 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1465  hypothetical protein  46.35 
 
 		 235 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1941  hypothetical protein  47.72 
 
 		 246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.022094 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2337  hypothetical protein  47.72 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>