19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1465 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1465  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3251  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  487  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3136  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  487  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2077  hypothetical protein  99.57 
 
 
246 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1105  hypothetical protein  99.57 
 
 
236 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1384  hypothetical protein  99.57 
 
 
246 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2369  hypothetical protein  99.57 
 
 
246 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2337  hypothetical protein  97.45 
 
 
246 aa  454  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1941  hypothetical protein  65.53 
 
 
246 aa  317  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.022094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3582  hypothetical protein  52.99 
 
 
278 aa  268  5e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144348  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53120  hypothetical protein  50.21 
 
 
260 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4657  hypothetical protein  51.32 
 
 
260 aa  255  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3654  hypothetical protein  47.21 
 
 
260 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1738  hypothetical protein  46.35 
 
 
261 aa  241  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4085  hypothetical protein  46.58 
 
 
264 aa  240  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3952  hypothetical protein  45.73 
 
 
271 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0117815  decreased coverage  0.00400212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1353  hypothetical protein  45.73 
 
 
261 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.788281  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1762  hypothetical protein  45.73 
 
 
261 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1369  hypothetical protein  44.02 
 
 
261 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>