19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3952 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3952  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0117815  decreased coverage  0.00400212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1762  hypothetical protein  99.62 
 
 		 261 aa  547  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1353  hypothetical protein  98.47 
 
 		 261 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.788281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1369  hypothetical protein  90.04 
 
 		 261 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4085  hypothetical protein  73.18 
 
 		 264 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3654  hypothetical protein  69.92 
 
 		 260 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1738  hypothetical protein  68.87 
 
 		 261 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53120  hypothetical protein  69.88 
 
 		 260 aa  377  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4657  hypothetical protein  69.48 
 
 		 260 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3582  hypothetical protein  53.39 
 
 		 278 aa  289  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3251  hypothetical protein  46.06 
 
 		 246 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3136  hypothetical protein  46.06 
 
 		 246 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1384  hypothetical protein  45.64 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2369  hypothetical protein  45.64 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2077  hypothetical protein  45.64 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1465  hypothetical protein  45.73 
 
 		 235 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1105  hypothetical protein  45.11 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2337  hypothetical protein  47.3 
 
 		 246 aa  228  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1941  hypothetical protein  46.47 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.022094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>