19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1105 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA2077  hypothetical protein  99.58 
 
 
246 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1105  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1384  hypothetical protein  99.58 
 
 
246 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2369  hypothetical protein  99.58 
 
 
246 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1465  hypothetical protein  99.57 
 
 
235 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3251  hypothetical protein  99.15 
 
 
246 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3136  hypothetical protein  99.15 
 
 
246 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2337  hypothetical protein  96.61 
 
 
246 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1941  hypothetical protein  65.68 
 
 
246 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.022094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3582  hypothetical protein  52.54 
 
 
278 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144348  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53120  hypothetical protein  49.79 
 
 
260 aa  257  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4657  hypothetical protein  50.87 
 
 
260 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3654  hypothetical protein  47.01 
 
 
260 aa  245  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1738  hypothetical protein  46.15 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4085  hypothetical protein  46.38 
 
 
264 aa  241  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3952  hypothetical protein  45.11 
 
 
271 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0117815  decreased coverage  0.00400212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1353  hypothetical protein  45.11 
 
 
261 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.788281  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1762  hypothetical protein  45.11 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1369  hypothetical protein  43.4 
 
 
261 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>