19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3654 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3654  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1738  hypothetical protein  94.23 
 
 
261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4085  hypothetical protein  80.57 
 
 
264 aa  428  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4657  hypothetical protein  72.66 
 
 
260 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53120  hypothetical protein  71.88 
 
 
260 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1762  hypothetical protein  70.31 
 
 
261 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1353  hypothetical protein  70.82 
 
 
261 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.788281  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3952  hypothetical protein  69.92 
 
 
271 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0117815  decreased coverage  0.00400212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1369  hypothetical protein  68.75 
 
 
261 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3582  hypothetical protein  53.44 
 
 
278 aa  287  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144348  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1384  hypothetical protein  47.3 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2369  hypothetical protein  47.3 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2077  hypothetical protein  47.3 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3251  hypothetical protein  47.3 
 
 
246 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3136  hypothetical protein  47.3 
 
 
246 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1105  hypothetical protein  47.01 
 
 
236 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1465  hypothetical protein  47.21 
 
 
235 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2337  hypothetical protein  48.13 
 
 
246 aa  235  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1941  hypothetical protein  47.72 
 
 
246 aa  235  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.022094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>