More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0801 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0801  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00557608  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  51.08 
 
 		 180 aa  173  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  50.54 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  46.59 
 
 		 177 aa  168  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  49.73 
 
 		 181 aa  167  6e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 179 aa  167  9e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 178 aa  167  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  48.33 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0173  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111848  decreased coverage  0.0000538106 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  47.83 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  47.83 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 184 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  46.96 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4302  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000025349  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 178 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0420  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 176 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146795  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  49.13 
 
 		 184 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  47.22 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  47.51 
 
 		 180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27601  Plastid ribosomal protein L6 large ribosomal subunit  45.81 
 
 		 213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.935341  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  161  6e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  46.59 
 
 		 177 aa  160  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4675  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 176 aa  161  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105609  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 176 aa  160  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  45.81 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  46.02 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  50.83 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  45.56 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  48.62 
 
 		 179 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  48.62 
 
 		 179 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  158  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 182 aa  158  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1146  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 178 aa  158  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000104709  hitchhiker  0.00466337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  44.89 
 
 		 177 aa  158  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  45.86 
 
 		 179 aa  157  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  45.86 
 
 		 178 aa  157  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  46.11 
 
 		 179 aa  157  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 177 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 177 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 177 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0185  50S ribosomal protein L6  44.89 
 
 		 177 aa  157  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922994  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  47.28 
 
 		 179 aa  157  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00953  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 		 177 aa  157  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0734749  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  45.76 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  46.67 
 
 		 178 aa  157  9e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  49.41 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0448  50S ribosomal protein L6  45.51 
 
 		 175 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.935491  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  44.32 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  45.11 
 
 		 184 aa  156  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  45.81 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  45.45 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  46.33 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  47.28 
 
 		 179 aa  156  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  47.8 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  48.63 
 
 		 179 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  45.86 
 
 		 180 aa  155  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  47.57 
 
 		 178 aa  156  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  46.96 
 
 		 180 aa  156  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  44.32 
 
 		 175 aa  155  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  44.32 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3744  50S ribosomal protein L6  43.18 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640948  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  46.63 
 
 		 178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 179 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0509  50S ribosomal protein L6  45 
 
 		 175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.910827  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  46.49 
 
 		 181 aa  154  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 177 aa  154  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  45.86 
 
 		 179 aa  154  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 179 aa  154  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4041  50S ribosomal protein L6  43.75 
 
 		 177 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000805939  unclonable  0.00000000000307302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4155  50S ribosomal protein L6  43.75 
 
 		 177 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000600192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0215  50S ribosomal protein L6  43.75 
 
 		 177 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000103444  hitchhiker  0.000114271 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0211  50S ribosomal protein L6  43.75 
 
 		 177 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000116546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>