More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0501 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0501  sodium:dicarboxylate symporter family protein  100 
 
 
415 aa  804    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0229  sodium/glutamate symporter family protein, putative  45.78 
 
 
394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.909208  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0947  hypothetical protein  45.67 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0449  Sodium:dicarboxylate symporter  47.33 
 
 
426 aa  307  3e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0917  hypothetical protein  45.14 
 
 
426 aa  305  9.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0581  sodium:dicarboxylate symporter family protein  46.26 
 
 
378 aa  290  4e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  28.31 
 
 
427 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  28.92 
 
 
436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  27.79 
 
 
436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  28.75 
 
 
436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  28.25 
 
 
444 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  28.25 
 
 
444 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  26.56 
 
 
432 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  27.98 
 
 
444 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  26.84 
 
 
413 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  28.25 
 
 
444 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0661  sodium:dicarboxylate symporter  26.8 
 
 
441 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0107528  normal  0.201117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  26.57 
 
 
437 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  27.1 
 
 
441 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  26.33 
 
 
437 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  26.63 
 
 
440 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6400  sodium:dicarboxylate symporter  28.32 
 
 
470 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  26.95 
 
 
440 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  26.95 
 
 
440 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  27.55 
 
 
409 aa  121  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  26.95 
 
 
440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  29.33 
 
 
425 aa  119  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  29.68 
 
 
405 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  27.44 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  27.7 
 
 
434 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  27.35 
 
 
437 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  25.87 
 
 
437 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  27.35 
 
 
449 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  26.06 
 
 
437 aa  117  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  27.72 
 
 
430 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  27.7 
 
 
433 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  27.15 
 
 
439 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  26.99 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  25.69 
 
 
481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.65 
 
 
437 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  26.5 
 
 
443 aa  114  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  26.56 
 
 
417 aa  114  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  26.77 
 
 
439 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  26.07 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  26.83 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  28.49 
 
 
409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  26.46 
 
 
424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3042  sodium:dicarboxylate symporter  27.91 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2948  sodium:dicarboxylate symporter  27.91 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00484228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  26.26 
 
 
449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  26.18 
 
 
435 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  26.18 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  26.18 
 
 
440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  24.19 
 
 
444 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  27.82 
 
 
436 aa  111  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  26.42 
 
 
411 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  25.12 
 
 
437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  25.69 
 
 
433 aa  110  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  27.75 
 
 
439 aa  110  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0917  Sodium:dicarboxylate symporter  26.29 
 
 
420 aa  109  8.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0420042  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  27.2 
 
 
419 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  25.12 
 
 
437 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  26.22 
 
 
410 aa  109  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  27.1 
 
 
441 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  25.07 
 
 
411 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  25.95 
 
 
411 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  25.07 
 
 
411 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  25.07 
 
 
411 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  25.07 
 
 
411 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  28.32 
 
 
405 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  27.51 
 
 
409 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  25.07 
 
 
411 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  25.25 
 
 
457 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  27.2 
 
 
428 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  25.07 
 
 
411 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2861  Sodium/dicarboxylate symporter  28.12 
 
 
424 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0942349  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  26.3 
 
 
434 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  26.58 
 
 
434 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  27.32 
 
 
417 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  24.82 
 
 
457 aa  107  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  25.07 
 
 
411 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3229  sodium:dicarboxylate symporter  27.63 
 
 
439 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  26.05 
 
 
419 aa  106  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  25.34 
 
 
411 aa  106  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  24.8 
 
 
411 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  25.77 
 
 
451 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  28.3 
 
 
438 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  26.68 
 
 
416 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1093  sodium:dicarboxylate symporter  26.6 
 
 
425 aa  104  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  26.22 
 
 
424 aa  104  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  26.68 
 
 
416 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  26.2 
 
 
419 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  27.72 
 
 
409 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2790  sodium:dicarboxylate symporter  28.46 
 
 
425 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255988  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  24.11 
 
 
445 aa  103  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  24.81 
 
 
447 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  27.17 
 
 
409 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  26.58 
 
 
457 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  27.42 
 
 
412 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  26.24 
 
 
425 aa  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>