More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0344 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0344  hypothetical protein  100 
 
 		 619 aa  1249    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167454  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  29.41 
 
 		 439 aa  124  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0351  membrane-associated zinc metalloprotease  25.7 
 
 		 549 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1940  membrane-associated zinc metalloprotease  25.12 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  31.31 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.58 
 
 		 558 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  38.12 
 
 		 438 aa  108  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  42.68 
 
 		 352 aa  108  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  36.2 
 
 		 370 aa  107  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  38.36 
 
 		 356 aa  107  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1638  membrane-associated zinc metalloprotease  31.91 
 
 		 454 aa  106  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  33.22 
 
 		 428 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  42.74 
 
 		 369 aa  104  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.83 
 
 		 561 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  35.29 
 
 		 561 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.95 
 
 		 339 aa  103  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  35.29 
 
 		 561 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2341  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.37 
 
 		 450 aa  103  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00281256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.83 
 
 		 367 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.42 
 
 		 452 aa  103  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  32.42 
 
 		 452 aa  103  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  40.74 
 
 		 363 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  37.95 
 
 		 347 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  39.62 
 
 		 355 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  40.74 
 
 		 354 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.89 
 
 		 368 aa  101  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  40.74 
 
 		 354 aa  101  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  37.04 
 
 		 396 aa  101  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0118  RIP metalloprotease RseP  34.57 
 
 		 433 aa  101  5e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  39.88 
 
 		 469 aa  100  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.17 
 
 		 446 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  39.24 
 
 		 430 aa  100  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.27 
 
 		 368 aa  100  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  38.46 
 
 		 438 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.65 
 
 		 368 aa  100  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0260  peptidase M50  36.84 
 
 		 496 aa  99.8  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3363  peptidase M50  35.36 
 
 		 681 aa  99.8  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.25912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.17 
 
 		 355 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0951  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.94 
 
 		 495 aa  99.4  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000274042  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.58 
 
 		 345 aa  99.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  31.88 
 
 		 450 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  32.55 
 
 		 446 aa  97.8  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  33.17 
 
 		 450 aa  97.1  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.52 
 
 		 351 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  28.25 
 
 		 466 aa  96.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  40.79 
 
 		 351 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.2 
 
 		 357 aa  95.9  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40 
 
 		 354 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  33.12 
 
 		 354 aa  95.1  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  41.45 
 
 		 351 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.52 
 
 		 450 aa  95.1  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  30.47 
 
 		 453 aa  95.1  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.02 
 
 		 347 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.48 
 
 		 355 aa  94.7  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  31.14 
 
 		 452 aa  94.4  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  28.4 
 
 		 448 aa  94  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  32.11 
 
 		 463 aa  93.6  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.4 
 
 		 368 aa  92  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  31.06 
 
 		 450 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  31.06 
 
 		 450 aa  92  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  31.06 
 
 		 450 aa  92  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.02 
 
 		 350 aa  92  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  31.06 
 
 		 450 aa  92  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  35.58 
 
 		 370 aa  91.7  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  29.12 
 
 		 355 aa  92  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  31.06 
 
 		 450 aa  92  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  38.56 
 
 		 353 aa  92  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  31.06 
 
 		 450 aa  92  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.91 
 
 		 461 aa  91.7  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  28.7 
 
 		 450 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  35.8 
 
 		 360 aa  90.9  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.75 
 
 		 457 aa  90.9  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  28.34 
 
 		 453 aa  90.9  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.55 
 
 		 355 aa  90.9  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.5 
 
 		 347 aa  90.9  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  33.11 
 
 		 463 aa  90.9  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.19 
 
 		 335 aa  90.5  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  30.24 
 
 		 450 aa  90.5  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.08 
 
 		 372 aa  90.5  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.75 
 
 		 372 aa  90.1  9e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.87 
 
 		 450 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1279  putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.15 
 
 		 456 aa  90.5  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.253686  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.71 
 
 		 479 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  35.76 
 
 		 354 aa  90.1  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5067  membrane-associated zinc metalloprotease  36.6 
 
 		 367 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  30.72 
 
 		 450 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.17 
 
 		 453 aa  89.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.63 
 
 		 480 aa  90.1  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0689  peptidase M50  33.48 
 
 		 376 aa  90.1  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000148024  hitchhiker  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.73 
 
 		 450 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  32.35 
 
 		 457 aa  89  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  33.17 
 
 		 453 aa  89.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.95 
 
 		 335 aa  89.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  33.7 
 
 		 446 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.48 
 
 		 450 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.46 
 
 		 458 aa  89  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  30.47 
 
 		 438 aa  88.6  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  34.97 
 
 		 376 aa  87.8  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0860  RIP metalloprotease RseP  42.06 
 
 		 370 aa  87.8  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  28.24 
 
 		 450 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>