172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13749 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13749  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.369485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5529  cell wall hydrolase/autolysin  76.74 
 
 
246 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4905  cell wall hydrolase/autolysin  77.46 
 
 
251 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0385715  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4994  cell wall hydrolase/autolysin  77.46 
 
 
251 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5273  cell wall hydrolase/autolysin  77.46 
 
 
251 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467188  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1286  cell wall hydrolase/autolysin  71.69 
 
 
245 aa  333  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4010  cell wall hydrolase/autolysin  51.56 
 
 
254 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1357  cell wall hydrolase/autolysin  45.54 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0671  cell wall hydrolase/autolysin  45.54 
 
 
320 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4394  cell wall hydrolase/autolysin  42.72 
 
 
296 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0290  cell wall hydrolase/autolysin  40.83 
 
 
283 aa  165  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2753  cell wall hydrolase/autolysin  40 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.984252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9001  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase-like protein  40.08 
 
 
283 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5160  cell wall hydrolase/autolysin  41.26 
 
 
291 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3402  cell wall hydrolase/autolysin  37.25 
 
 
347 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4160  cell wall hydrolase/autolysin  42.86 
 
 
259 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00486305  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3352  cell wall hydrolase/autolysin  39.27 
 
 
290 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.939997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1163  cell wall hydrolase/autolysin  44.09 
 
 
301 aa  148  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2975  cell wall hydrolase/autolysin  31.9 
 
 
463 aa  93.2  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1398  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  24.76 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1080  cell wall hydrolase/autolysin  28.08 
 
 
703 aa  72.4  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000496227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1807  cell wall hydrolase/autolysin  26.56 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.49 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.344171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.93 
 
 
657 aa  65.9  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2941  cell wall hydrolase/autolysin  27.8 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000101461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3244  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.44 
 
 
815 aa  65.1  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4521  cell wall hydrolase/autolysin  27.49 
 
 
318 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0434  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.36 
 
 
317 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.19 
 
 
377 aa  62.4  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3789  cell wall hydrolase/autolysin  26.58 
 
 
538 aa  62  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0045  surface-layer n-acetylmuramoyl-l-alanine amidase  26.58 
 
 
531 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000055922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  27.4 
 
 
948 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1272  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.07 
 
 
242 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000305091 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1654  cell wall hydrolase/autolysin  24.79 
 
 
239 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3053  cell wall hydrolase/autolysin  23.15 
 
 
591 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0425538  normal  0.806567 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3067  cell wall hydrolase/autolysin  23.15 
 
 
591 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3265  cell wall hydrolase/autolysin  23.26 
 
 
556 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2296  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.11 
 
 
249 aa  58.5  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0714  cell wall hydrolase/autolysin  25.42 
 
 
568 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000891382  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15510  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.15 
 
 
746 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  26.5 
 
 
352 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  24.44 
 
 
410 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000010106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1687  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  22.78 
 
 
410 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000543314  hitchhiker  0.00000000000000117907 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0588  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  21.63 
 
 
315 aa  56.2  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0964307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.53 
 
 
474 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.35 
 
 
431 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  27.44 
 
 
387 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.64 
 
 
476 aa  55.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0213  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.45 
 
 
257 aa  55.5  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00242661  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  27.96 
 
 
392 aa  55.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1194  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.81 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00764454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2351  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.22 
 
 
410 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000872091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.22 
 
 
410 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000138501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.22 
 
 
410 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000564272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2221  protein of unknown function DUF187  24.89 
 
 
997 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10331  cell wall hydrolase/autolysin  25.79 
 
 
362 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.374691  normal  0.548996 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1297  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25 
 
 
410 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.111917  normal  0.539437 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3028  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.12 
 
 
435 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0809739  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1037  cell wall hydrolase/autolysin  25.79 
 
 
282 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  28.44 
 
 
381 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  22.22 
 
 
410 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1534  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.27 
 
 
562 aa  54.3  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0577934  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1825  cell wall hydrolase/autolysin  25.12 
 
 
590 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0111  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  21.96 
 
 
297 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0171096  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3223  cell wall hydrolase/autolysin  22.87 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4667  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.1 
 
 
404 aa  52.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.975026  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0664  cell wall hydrolase/autolysin  24.89 
 
 
339 aa  52.4  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0539  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  20.18 
 
 
268 aa  52  0.000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000536287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  21.96 
 
 
471 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2148  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.51 
 
 
522 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1410  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.29 
 
 
366 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1374  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.18 
 
 
529 aa  51.6  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.736006  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.11 
 
 
543 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1153  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.45 
 
 
731 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0113  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  21.5 
 
 
319 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4034  cell wall hydrolase/autolysin  26.11 
 
 
636 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.85 
 
 
352 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2310  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  21.81 
 
 
410 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3314  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.9 
 
 
447 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000664916  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.72 
 
 
907 aa  50.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0378  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  21.66 
 
 
286 aa  50.1  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0665  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.64 
 
 
399 aa  49.3  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.188608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3732  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25 
 
 
338 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000534753  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0885  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.53 
 
 
300 aa  49.3  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0020686  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1472  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.27 
 
 
352 aa  49.7  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.11 
 
 
576 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2268  cell wall hydrolase/autolysin  23.48 
 
 
585 aa  48.9  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2031  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.57 
 
 
359 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.95 
 
 
616 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2911  cell wall hydrolase/autolysin  22.87 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569075  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  25.46 
 
 
406 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07940  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  21.63 
 
 
383 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3678  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.56 
 
 
338 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0812  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.58 
 
 
406 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1714  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.24 
 
 
337 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000314617  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4053  cell wall hydrolase/autolysin  23.61 
 
 
585 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.630004  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2361  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.58 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0859  cell wall hydrolase/autolysin  23.91 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.751216 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  22.27 
 
 
530 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0332  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.09 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000783569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>