More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13359 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13359  transposase  100 
 
 
509 aa  1033    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10812  IS1547 transposase  100 
 
 
303 aa  592  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.156779  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0001  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  65.94 
 
 
352 aa  346  5e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0450  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  65.94 
 
 
354 aa  346  6e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1251  putative transposase fusion protein  80.53 
 
 
207 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1241  putative transposase fusion protein  77.72 
 
 
192 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1224  putative transposase fusion protein  77.72 
 
 
192 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4851  hypothetical protein  72.11 
 
 
192 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1576  hypothetical protein  75.27 
 
 
204 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.161558 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3522  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.74 
 
 
189 aa  156  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0689  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.58 
 
 
350 aa  147  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0431  alkylhydroperoxidase  38.76 
 
 
195 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5064  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.44 
 
 
203 aa  123  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.83 
 
 
184 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0488  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.1 
 
 
197 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.79 
 
 
327 aa  103  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3171  carboxymuconolactone decarboxylase  34.66 
 
 
201 aa  100  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11860  Transposase IS116/IS110/IS902 family  34.48 
 
 
356 aa  94.4  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4443  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.5 
 
 
147 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2861  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.13 
 
 
422 aa  90.1  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0437077  normal  0.0549681 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0284  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.96 
 
 
206 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1766  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.81 
 
 
354 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0961431  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  30.99 
 
 
185 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  30.99 
 
 
185 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20200  transposase  34.8 
 
 
378 aa  88.6  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04230  transposase  32.86 
 
 
402 aa  88.2  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.389305  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00780  transposase  32.87 
 
 
402 aa  87.8  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1688  carboxymuconolactone decarboxylase  30.23 
 
 
189 aa  87  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.02 
 
 
348 aa  86.7  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.02 
 
 
348 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.02 
 
 
348 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.02 
 
 
348 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.02 
 
 
348 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3968  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.42 
 
 
185 aa  86.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.02 
 
 
348 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  32.6 
 
 
182 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.6 
 
 
182 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  32.6 
 
 
182 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.6 
 
 
182 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  32.6 
 
 
182 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.73 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.04 
 
 
182 aa  85.1  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.04 
 
 
182 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.04 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.49 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.89 
 
 
348 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.89 
 
 
348 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.89 
 
 
348 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5540  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.67 
 
 
359 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.0244683 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.67 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.19 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  26.33 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2638  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.15 
 
 
407 aa  79.7  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2085  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.12 
 
 
364 aa  79.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000256  normal  0.0160957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2255  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.12 
 
 
364 aa  79.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000526829  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.2 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  25 
 
 
411 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000892616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.71 
 
 
411 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2223  transposase, IS110 family, OrfA  26.33 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92844e-48 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.22 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3141  hypothetical protein  36.22 
 
 
141 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1559  transposase for IS1663  25.18 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2362  hypothetical protein  40.2 
 
 
113 aa  72.4  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.671484  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5526  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112316  hitchhiker  0.000000304553 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5538  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25664  hitchhiker  0.000556456 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1737  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4091  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240252  hitchhiker  0.0000000689904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0416  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0375  transposase IS116/IS110/IS902  28.57 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3502  transposase IS116/IS110/IS902  28.57 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4926  transposase IS116/IS110/IS902  28.57 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5506  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281542 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5513  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  unclonable  0.000000000996402  decreased coverage  0.00000000098172 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2024  transposase IS116/IS110/IS902  23.81 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000259984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.39 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2047  IS110 family transposase OrfB  32.23 
 
 
154 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2203  IS110 family transposase orfb  32.23 
 
 
154 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4393  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  28.44 
 
 
421 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3595  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.31 
 
 
315 aa  63.9  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.917263  normal  0.896237 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4269  transposase IS111A/IS1328/IS1533  26.32 
 
 
403 aa  63.5  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3501  transposase IS111A/IS1328/IS1533  26.32 
 
 
403 aa  63.5  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487928  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2824  transposase IS111A/IS1328/IS1533  26.32 
 
 
403 aa  63.5  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.51 
 
 
180 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0159  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.58 
 
 
343 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1021  hypothetical protein  22.58 
 
 
343 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12160  transposase  27.85 
 
 
408 aa  62.4  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145073  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2850  transposase IS116/IS110/IS902  29.75 
 
 
418 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.516093  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1122  carboxymuconolactone decarboxylase  25.86 
 
 
198 aa  61.6  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1983  transposase IS116/IS110/IS902  23.05 
 
 
394 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.43 
 
 
297 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.518265  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2868  transposase IS116/IS110/IS902  29.75 
 
 
418 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.666774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3253  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.34 
 
 
404 aa  61.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0896  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.34 
 
 
404 aa  61.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2886  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.34 
 
 
404 aa  61.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3901  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.34 
 
 
404 aa  61.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  31.01 
 
 
159 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  31.01 
 
 
159 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  30.26 
 
 
298 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>