More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11051 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  100 
 
 		 257 aa  512  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  77.14 
 
 		 255 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  63.36 
 
 		 236 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  64.68 
 
 		 271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  62.66 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  61.7 
 
 		 252 aa  294  9e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.26 
 
 		 273 aa  291  7e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  63.44 
 
 		 406 aa  289  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  62.93 
 
 		 250 aa  280  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  61.21 
 
 		 254 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  61.21 
 
 		 254 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  61.21 
 
 		 254 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  62.5 
 
 		 249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  59.48 
 
 		 286 aa  271  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.91 
 
 		 246 aa  268  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  53.5 
 
 		 246 aa  265  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.16 
 
 		 252 aa  265  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.83 
 
 		 243 aa  265  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.83 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  61.5 
 
 		 231 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  51.91 
 
 		 254 aa  251  7e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.63 
 
 		 244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.07 
 
 		 240 aa  243  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  53.1 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.14 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  52.42 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  52.65 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  53.81 
 
 		 236 aa  238  8e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.28 
 
 		 236 aa  237  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  50.21 
 
 		 243 aa  236  4e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.79 
 
 		 231 aa  235  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  54.42 
 
 		 239 aa  236  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.59 
 
 		 237 aa  235  7e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.61 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  48.1 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.71 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.55 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 240 aa  232  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.07 
 
 		 243 aa  231  8.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.34 
 
 		 235 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  50.87 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  51.71 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.32 
 
 		 233 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.16 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0569  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.29 
 
 		 248 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.94 
 
 		 244 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 227 aa  226  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 239 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 239 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 239 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  46.19 
 
 		 227 aa  224  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  46.19 
 
 		 227 aa  224  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  52.21 
 
 		 237 aa  224  9e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  46.19 
 
 		 227 aa  224  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.11 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  47.83 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  51.09 
 
 		 230 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  51.09 
 
 		 230 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  51.09 
 
 		 230 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  50.44 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 235 aa  221  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  47.56 
 
 		 247 aa  221  8e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 270 aa  221  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 227 aa  221  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.02 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  50 
 
 		 230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 225 aa  218  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  49.13 
 
 		 231 aa  219  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  50.22 
 
 		 234 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  47.14 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.79 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  48.29 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 236 aa  208  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 223 aa  207  9e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  45.23 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  45.5 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 235 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  44.59 
 
 		 224 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 224 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 225 aa  202  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>