More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2630 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2630  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
266 aa  518  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312135  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.26 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.367586  normal  0.455347 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0099  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter inner membrane protein  54.17 
 
 
277 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291864  normal  0.355691 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1541  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  51.25 
 
 
281 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.77 
 
 
275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.7 
 
 
275 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.7 
 
 
275 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.29 
 
 
251 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.660602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.29 
 
 
251 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606268  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.75 
 
 
251 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0456  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.31 
 
 
285 aa  203  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.41 
 
 
266 aa  199  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.61 
 
 
269 aa  198  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0865715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34520  ABC transporter permease  54.17 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132889  normal  0.0672965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2932  ABC transporter permease  54.17 
 
 
254 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0034  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.29 
 
 
276 aa  187  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.25 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.25 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.03471 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.51 
 
 
279 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.136509 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.25 
 
 
285 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0309  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47 
 
 
277 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
252 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
276 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0233  ABC transporter, permease protein  36.24 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1129  taurine transport system permease protein TauC  35.71 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.774255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
252 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.84 
 
 
261 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
273 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
273 aa  135  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
273 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
273 aa  135  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.41 
 
 
259 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.68 
 
 
311 aa  132  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1900  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.98 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128113  hitchhiker  0.000000000000910228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.07 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
291 aa  128  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324285  normal  0.0160388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  35.64 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  35.83 
 
 
287 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
288 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.1 
 
 
271 aa  125  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
252 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0620  taurine transport system permease protein TauC  31.92 
 
 
245 aa  124  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00071484  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
253 aa  123  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
273 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.06 
 
 
279 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  33.88 
 
 
273 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.29 
 
 
279 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0055  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  27.31 
 
 
256 aa  122  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  35.43 
 
 
279 aa  121  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  32.48 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  36.32 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.6 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  30.58 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.16 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.13 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0996  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.83 
 
 
286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  33.21 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.14 
 
 
279 aa  119  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.36 
 
 
279 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.55 
 
 
279 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.91 
 
 
331 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.69 
 
 
280 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.38 
 
 
279 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.71 
 
 
280 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  34.08 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  34.17 
 
 
279 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  31.75 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  31.58 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.97 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  31.8 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.96 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  31.58 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.69 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.14 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
286 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
264 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  31.66 
 
 
273 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30 
 
 
277 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30 
 
 
277 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  33.69 
 
 
295 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  31.1 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 
253 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
264 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  33.33 
 
 
299 aa  115  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2106  nitrate transport permease  36.07 
 
 
263 aa  116  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.727969  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 
283 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 
285 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 
283 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>