184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0857 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0857  CheW protein  100 
 
 		 168 aa  335  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.201526  normal  0.0222726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  43.24 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  46.76 
 
 		 171 aa  130  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1063  CheW protein  44.52 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  hitchhiker  0.0000389195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2794  CheW protein  39.19 
 
 		 165 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4604  CheW protein  34 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.447747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  34.19 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  35.9 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  35.9 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3777  CheW protein  27.74 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4056  CheW protein  26.32 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4018  CheW protein  26.32 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1424  CheW protein  32.41 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.27097  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  34.38 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  31.65 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  35.37 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1016  CheW protein  35 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0716  CheW protein  27.59 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  35.25 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  30.6 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0750  CheW protein  31.65 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0721  CheW protein  31.65 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  26.67 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  27.63 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  28.76 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  32.04 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  32.04 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  28.67 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  30.97 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  27.78 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  30.77 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  31.19 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  31.37 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  31.37 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  23.81 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  25.34 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  28.57 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  26.79 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  29.91 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  27.56 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  31.67 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  30.13 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  27.46 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  22.6 
 
 		 253 aa  51.6  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  30.28 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  31.21 
 
 		 154 aa  51.2  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.81 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  27.14 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  31.07 
 
 		 154 aa  50.8  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  31.25 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.87 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  27.73 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  25.87 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2527  CheW-like protein  27.21 
 
 		 297 aa  50.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  25.87 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  25.87 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  28.21 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  25.87 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.1 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  22.22 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  25.86 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  25.87 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  30.08 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  32.11 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  25.17 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  29.13 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  25.87 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  30.7 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  25.87 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  29.81 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  25.87 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  25.87 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  29.08 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2364  response regulator receiver modulated CheW protein  24.84 
 
 		 297 aa  48.5  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  25.62 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  31.43 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  27.21 
 
 		 299 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  27.21 
 
 		 299 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.06 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  37.84 
 
 		 171 aa  47.8  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  26.06 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  26.06 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  26.06 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  27.21 
 
 		 299 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  27.1 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  25.35 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  25.35 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  29.81 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  25.41 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  25.56 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  26.24 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  25.56 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  25.41 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  27.21 
 
 		 299 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  27.68 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  27.41 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  28.32 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  27.21 
 
 		 295 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  30.83 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  32.5 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>