269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2210 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  100 
 
 
357 aa  705    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  66.09 
 
 
387 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  34.27 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  33.97 
 
 
358 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  28.85 
 
 
495 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  28.85 
 
 
495 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  27.48 
 
 
473 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  26.18 
 
 
495 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  30.29 
 
 
478 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  31.72 
 
 
508 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  29.57 
 
 
551 aa  113  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  27.95 
 
 
492 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17951  hypothetical protein  29.07 
 
 
417 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1375  polysaccharide export-related periplasmic protein  26.11 
 
 
415 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00608351  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08781  hypothetical protein  25.65 
 
 
415 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000165811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  27.93 
 
 
446 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0827  polysaccharide export protein  28.19 
 
 
456 aa  92.8  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.895511  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16271  hypothetical protein  24.18 
 
 
577 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  29.11 
 
 
580 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  26.87 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  24.77 
 
 
830 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  26.25 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  30.85 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  27.27 
 
 
781 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  27.27 
 
 
948 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  26.79 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4235  polysaccharide export protein  31.91 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.694304  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  30.43 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  27.54 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  30.43 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  23.87 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  24.81 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  27.65 
 
 
478 aa  70.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  29.01 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  24.83 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  26.71 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  26.94 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  26.69 
 
 
264 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  26.28 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  25.37 
 
 
846 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  26.18 
 
 
700 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  27.46 
 
 
276 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  28.93 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  27.71 
 
 
407 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  26.85 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  26.25 
 
 
264 aa  63.9  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  28.24 
 
 
214 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  25.91 
 
 
700 aa  63.5  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  26.51 
 
 
391 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  24.41 
 
 
268 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  26.67 
 
 
383 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  23.72 
 
 
1055 aa  62.8  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4096  polysaccharide export protein  27.01 
 
 
407 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512388  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  25.09 
 
 
426 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  26.1 
 
 
426 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  26.02 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  26.67 
 
 
423 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  26.02 
 
 
387 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  27.01 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  26.02 
 
 
387 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  26.67 
 
 
423 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4112  polysaccharide export protein  27.03 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  25.55 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  24.14 
 
 
277 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6263  polysaccharide export protein  26.94 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527808  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  23.64 
 
 
833 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  26.88 
 
 
241 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  26.15 
 
 
369 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  25.65 
 
 
392 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  24.91 
 
 
362 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  25.42 
 
 
606 aa  60.1  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  24.71 
 
 
324 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  25.9 
 
 
348 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  25.65 
 
 
397 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  28.29 
 
 
201 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  26.72 
 
 
277 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  36.5 
 
 
419 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  26.64 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  27.04 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  22.78 
 
 
373 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  23.87 
 
 
915 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  31.96 
 
 
425 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  23.91 
 
 
834 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  24.64 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  24.54 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  22.65 
 
 
869 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  38.68 
 
 
153 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  24.54 
 
 
392 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  26.33 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  23.64 
 
 
317 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  27.1 
 
 
378 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  27.84 
 
 
431 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  26.34 
 
 
270 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.87 
 
 
378 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  22.34 
 
 
936 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  25.23 
 
 
347 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  22.66 
 
 
931 aa  56.6  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  21.8 
 
 
576 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  23.29 
 
 
417 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  27.65 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>