More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0257 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 
204 aa  418  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2087  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  74.26 
 
 
204 aa  324  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24681  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  68 
 
 
210 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03331  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  58.5 
 
 
206 aa  262  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1621  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  58.29 
 
 
206 aa  259  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3761  isopropylmalate isomerase small subunit  57.59 
 
 
197 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3810  isopropylmalate isomerase small subunit  57.59 
 
 
197 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3629  isopropylmalate isomerase small subunit  55.26 
 
 
206 aa  234  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02811  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  53.27 
 
 
207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2548  isopropylmalate isomerase small subunit  56.84 
 
 
202 aa  227  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0488432  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5027  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  54.21 
 
 
201 aa  223  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02771  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  53.09 
 
 
207 aa  217  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.385201  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02881  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  50 
 
 
206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.130398  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.06 
 
 
207 aa  214  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.420219  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3966  isopropylmalate isomerase small subunit  51.52 
 
 
202 aa  214  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.0175805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1327  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.31 
 
 
197 aa  213  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.507856  normal  0.452578 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02781  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  50.78 
 
 
212 aa  211  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0321  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.25 
 
 
203 aa  202  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00352929  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0871  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.53 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2681  isopropylmalate isomerase small subunit  47.15 
 
 
201 aa  186  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2764  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.19 
 
 
211 aa  182  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1847  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  45.31 
 
 
201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0900  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.24 
 
 
223 aa  180  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2657  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.67 
 
 
214 aa  177  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0643  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.56 
 
 
206 aa  176  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1545  aconitate hydratase domain protein  45.6 
 
 
209 aa  174  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.831045  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1602  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.55 
 
 
201 aa  174  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0187865 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0667  isopropylmalate isomerase small subunit  41.58 
 
 
202 aa  159  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  38.22 
 
 
201 aa  124  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  35.71 
 
 
201 aa  121  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  35.2 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  35.2 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  35.26 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  35.26 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  35.26 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  36.46 
 
 
201 aa  118  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  34.18 
 
 
201 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  35.71 
 
 
201 aa  117  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  36.08 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  34.18 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  34.36 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  35.94 
 
 
201 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  34.87 
 
 
201 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  35.94 
 
 
201 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  39.87 
 
 
201 aa  115  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1446  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  36.22 
 
 
215 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00452839  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1382  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  36.22 
 
 
215 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  0.419844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  35.94 
 
 
201 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  39.46 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  34.38 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  35.42 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  35.42 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  34.29 
 
 
216 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  34.9 
 
 
201 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  33.33 
 
 
200 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  37.91 
 
 
201 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  35.57 
 
 
200 aa  111  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0215  isopropylmalate isomerase small subunit  37.7 
 
 
202 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.20437 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  33.68 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  34.38 
 
 
200 aa  111  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  37.74 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  35.57 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  33.33 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  33.68 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  34.54 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  33.16 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0863  isopropylmalate isomerase small subunit  33.84 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000359889  hitchhiker  0.000927879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  35 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  38.61 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  33.68 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  34.55 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  38.61 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  33.68 
 
 
201 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  33.68 
 
 
201 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  33.68 
 
 
201 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35.45 
 
 
201 aa  109  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  33.68 
 
 
201 aa  109  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  33.68 
 
 
201 aa  109  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  33.68 
 
 
201 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5021  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  33.33 
 
 
214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447275  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  37.08 
 
 
201 aa  108  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35.94 
 
 
207 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  37.1 
 
 
201 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  33.33 
 
 
200 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40 
 
 
195 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  38.51 
 
 
209 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  37.34 
 
 
201 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3069  isopropylmalate isomerase small subunit  33.33 
 
 
212 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  37.1 
 
 
201 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  36.07 
 
 
240 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  33.33 
 
 
216 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  36.26 
 
 
200 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  33.33 
 
 
217 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  38.82 
 
 
204 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  37.34 
 
 
201 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  37.06 
 
 
218 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  35.44 
 
 
214 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  30.65 
 
 
204 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  38.26 
 
 
201 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  36.31 
 
 
214 aa  105  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>