More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3657 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3657  sulfatase  100 
 
 
494 aa  1034    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000376885  normal  0.0602445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5209  sulfatase  33.47 
 
 
603 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283658  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5650  sulfatase  33.47 
 
 
603 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.372268  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2367  sulfatase family protein  34.85 
 
 
558 aa  243  5e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2520  sulfatase  32.19 
 
 
607 aa  233  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.541987  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1566  sulfatase  31.99 
 
 
630 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145604  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2626  sulfatase  30.7 
 
 
624 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342273  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0762  sulfatase  29.86 
 
 
576 aa  195  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.378263  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2695  sulfatase  32.29 
 
 
486 aa  179  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000809096  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0440  sulfatase  27.44 
 
 
431 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  26.76 
 
 
481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2826  sulfatase  26.64 
 
 
500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.250394 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3336  sulfatase  26.47 
 
 
482 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.990519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2349  sulfatase  28.73 
 
 
437 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1562  sulfatase  25.42 
 
 
477 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3375  sulfatase  24.84 
 
 
474 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3825  sulfatase  25.94 
 
 
451 aa  123  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1841  sulfatase  25.76 
 
 
554 aa  123  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10303  sulfatase  26.1 
 
 
465 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000455468  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4597  sulfatase  24.32 
 
 
614 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1723  sulfatase  26.88 
 
 
454 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0122  sulfatase  26.55 
 
 
458 aa  114  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0390  sulfatase  25.06 
 
 
465 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0399  sulfatase  25.06 
 
 
465 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.603146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0378  sulfatase  25.06 
 
 
465 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0510065  normal  0.447114 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  23.51 
 
 
537 aa  96.7  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  28.43 
 
 
535 aa  95.1  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  26.61 
 
 
466 aa  94.4  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0798  sulfatase  22.95 
 
 
518 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0822937  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  26.76 
 
 
452 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  24.67 
 
 
535 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  24.67 
 
 
535 aa  92.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  24.67 
 
 
535 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  26.42 
 
 
482 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  25.22 
 
 
631 aa  91.3  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  25.15 
 
 
449 aa  90.5  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1354  sulfatase  25.32 
 
 
621 aa  90.5  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  24.94 
 
 
502 aa  90.1  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  25.1 
 
 
486 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  25.41 
 
 
453 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  26.09 
 
 
486 aa  88.6  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2825  sulfatase  25.25 
 
 
464 aa  87  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.424556  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  24.36 
 
 
497 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0706  sulfatase  24.04 
 
 
576 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  26.59 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3398  sulfatase  23.29 
 
 
524 aa  84.7  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145395  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0795  sulfatase  22.83 
 
 
549 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0245615  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  24.77 
 
 
472 aa  84  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  24.93 
 
 
497 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  24.93 
 
 
497 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  25.16 
 
 
486 aa  84  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  25.57 
 
 
497 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  25.57 
 
 
497 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4179  sulfatase  26.44 
 
 
514 aa  83.2  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  30.57 
 
 
565 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  25.55 
 
 
491 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  24.71 
 
 
487 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  25.79 
 
 
497 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  23.88 
 
 
497 aa  80.1  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  23.64 
 
 
564 aa  80.5  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  26.1 
 
 
490 aa  80.1  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  24.36 
 
 
627 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  32.22 
 
 
470 aa  80.1  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  25.74 
 
 
484 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  26.51 
 
 
457 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  34.62 
 
 
526 aa  79.7  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  23 
 
 
489 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  23.97 
 
 
480 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  22.46 
 
 
459 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  24.52 
 
 
453 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  24.17 
 
 
485 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  38.1 
 
 
586 aa  77.8  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  31.39 
 
 
511 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  23.48 
 
 
523 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  25.44 
 
 
510 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  35.11 
 
 
535 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  34.38 
 
 
499 aa  75.1  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  21.99 
 
 
517 aa  75.1  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  26.3 
 
 
462 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  35.56 
 
 
474 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  25.23 
 
 
453 aa  73.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  26.38 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  31.54 
 
 
501 aa  73.6  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  22.98 
 
 
482 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  22.96 
 
 
483 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  24.21 
 
 
539 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  21.96 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  25.92 
 
 
492 aa  70.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2234  sulfatase  29.88 
 
 
506 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  24.05 
 
 
489 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  23 
 
 
559 aa  70.5  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  21.33 
 
 
465 aa  70.5  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  31.88 
 
 
488 aa  70.5  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  24.42 
 
 
471 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  23.28 
 
 
500 aa  69.7  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  24.59 
 
 
479 aa  69.7  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  21.58 
 
 
489 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  23.42 
 
 
440 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  22.44 
 
 
590 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  22.38 
 
 
519 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>