More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4334 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4334  luciferase family protein  100 
 
 		 385 aa  780    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.905772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0815  luciferase family protein  46.96 
 
 		 376 aa  295  9e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4260  luciferase family protein  41.44 
 
 		 380 aa  287  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  41.21 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6112  Luciferase-like monooxygenase  40.05 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4272  luciferase family protein  41.55 
 
 		 378 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3199  bacterial luciferase family protein  41.71 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3065  luciferase  40.44 
 
 		 392 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0528805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.09 
 
 		 380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  36.97 
 
 		 371 aa  223  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  35.36 
 
 		 367 aa  202  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  32.64 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  31.79 
 
 		 387 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  33.94 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  31.23 
 
 		 353 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  29.29 
 
 		 355 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  30.27 
 
 		 389 aa  142  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7216  monooxygenase  29.76 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.310211  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  33.15 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  33.15 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  32.51 
 
 		 406 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.86 
 
 		 364 aa  139  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  32.88 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  30.08 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  30.64 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  30.48 
 
 		 364 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  29.77 
 
 		 363 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  29.85 
 
 		 389 aa  136  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  29.48 
 
 		 363 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  31.36 
 
 		 358 aa  135  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  29.41 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  28.05 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1128  monooxygenase of the alternative pyrimidine degradation pathway  30.62 
 
 		 360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  29.89 
 
 		 367 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2625  Luciferase-like monooxygenase  31.25 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0284237  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  29.68 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1823  luciferase family protein  31.09 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.463883  normal  0.116387 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  29.62 
 
 		 367 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  29.19 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1738  luciferase family protein  31.85 
 
 		 372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4216  luciferase family protein  31.29 
 
 		 363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  29.35 
 
 		 367 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 395 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  29.35 
 
 		 367 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  29.35 
 
 		 367 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  28.9 
 
 		 364 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4506  Luciferase-like, subgroup  30.47 
 
 		 364 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2057  Luciferase-like monooxygenase  31.59 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.0602749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  28.81 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  29.12 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2113  putative monooxygenase rutA  29.97 
 
 		 363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  29.13 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1525  luciferase family protein  31.75 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2630  Luciferase-like monooxygenase  29.97 
 
 		 363 aa  126  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1157  bacterial luciferase family protein  31.22 
 
 		 383 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3663  alkanesulfonate monooxygenase  30.26 
 
 		 370 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3956  Alkanesulfonate monooxygenase  30.26 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0999  luciferase  31.02 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1130  putative monooxygenase rutA  29.69 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.69729  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1075  Luciferase-like monooxygenase  31.51 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.0331405 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  29.94 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01015  predicted monooxygenase  29.69 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01022  hypothetical protein  29.69 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1249  putative monooxygenase rutA  29.69 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1127  putative monooxygenase rutA  29.69 
 
 		 393 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  30 
 
 		 364 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  29.86 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2583  luciferase family protein  29.69 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3938  pyrimidine utilization protein A  30.08 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252871  normal  0.0210815 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  29.66 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0025  alkanesulfonate monooxygenase  30.81 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250333  normal  0.590085 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  29.09 
 
 		 425 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  29.91 
 
 		 378 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  29.71 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00760  putative enzyme  29.1 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7126  hypothetical protein  30.58 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4838  Luciferase-like monooxygenase  30.49 
 
 		 370 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  26.92 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3982  luciferase family protein  30.06 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  27.78 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  26.92 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  27.09 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  26.37 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  28.92 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  26.63 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1584  luciferase family protein  30.14 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  27.4 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  27.05 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  25.74 
 
 		 385 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  27.59 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1168  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  24.45 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  32.64 
 
 		 360 aa  102  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1543  DszA family monooxygenase  29.48 
 
 		 456 aa  99.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.9269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  27.3 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5869  alkanesulfonate monooxygenase  30.91 
 
 		 350 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1906  DszA family monooxygenase  28.49 
 
 		 457 aa  96.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2963  alkanesulfonate monooxygenase  28.93 
 
 		 370 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.382822  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  29.7 
 
 		 367 aa  96.3  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2958  alkanesulfonate monooxygenase  28.62 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>