More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2062 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2062  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 172 aa  343  8.999999999999999e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 159 aa  150  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  45.58 
 
 		 157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 174 aa  124  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 153 aa  124  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 153 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  42.57 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 155 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  39.46 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  40.14 
 
 		 154 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 176 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 153 aa  111  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  40.41 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  39.16 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3163  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 155 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  44.44 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  38.46 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  38.46 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  38.46 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  38.46 
 
 		 229 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2774  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315931  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  38.46 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3626  AsnC family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00949051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 153 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  37.76 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 152 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 149 aa  104  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 172 aa  104  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3658  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 149 aa  104  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 175 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 156 aa  102  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 169 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 175 aa  100  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6081  transcriptional regulator  36.09 
 
 		 144 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0682  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 175 aa  98.6  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 157 aa  98.2  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 155 aa  97.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0427  transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 		 150 aa  97.4  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  97.4  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 167 aa  97.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 151 aa  97.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 177 aa  97.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>