More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3658 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3658  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  302  9.000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0071  AsnC family transcriptional regulator  75.52 
 
 		 155 aa  224  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  53.85 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3254  transcriptional regulator, AsnC family  57.81 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  51.75 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2383  transcriptional regulator, AsnC family  51.05 
 
 		 152 aa  143  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000319505  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  46.21 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7984  transcriptional regulator, AsnC family  46.21 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  42.18 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 181 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 155 aa  116  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  45.07 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 156 aa  114  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  41.96 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  40.97 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  43.66 
 
 		 152 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0427  transcriptional regulator, AsnC family  42.96 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.46 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 169 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 		 165 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.58 
 
 		 169 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  39.86 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  42.96 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  39.46 
 
 		 169 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 		 157 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 155 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 152 aa  106  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0927  leucine-responsive regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.41 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  36.81 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  39.86 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  36.11 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  37.06 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  38.78 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  36.81 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  36.81 
 
 		 164 aa  104  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  36.81 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  36.81 
 
 		 164 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  36.81 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  36.81 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  36.81 
 
 		 164 aa  104  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  36.81 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  36.81 
 
 		 164 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  36.81 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  36.81 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  36.11 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>