More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1168 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1168  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  100 
 
 		 366 aa  754    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4216  luciferase family protein  53.91 
 
 		 363 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  35.06 
 
 		 358 aa  239  8e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4506  Luciferase-like, subgroup  34.57 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0991  luciferase family protein  33.14 
 
 		 355 aa  236  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.975464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02080  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.48 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1792  luciferase family protein  35.31 
 
 		 354 aa  226  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  0.083169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2625  Luciferase-like monooxygenase  30.83 
 
 		 353 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0284237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1823  luciferase family protein  30.83 
 
 		 366 aa  192  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.463883  normal  0.116387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2057  Luciferase-like monooxygenase  31.75 
 
 		 376 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.0602749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1584  luciferase family protein  32.31 
 
 		 381 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1738  luciferase family protein  31.75 
 
 		 372 aa  189  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01015  predicted monooxygenase  31.11 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1130  putative monooxygenase rutA  31.11 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.69729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2583  luciferase family protein  31.11 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1127  putative monooxygenase rutA  31.11 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1249  putative monooxygenase rutA  31.11 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01022  hypothetical protein  31.11 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2630  Luciferase-like monooxygenase  31.11 
 
 		 363 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2113  putative monooxygenase rutA  30.83 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1075  Luciferase-like monooxygenase  31.65 
 
 		 376 aa  186  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.0331405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3938  pyrimidine utilization protein A  31.18 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252871  normal  0.0210815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1525  luciferase family protein  29.97 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4838  Luciferase-like monooxygenase  30.53 
 
 		 370 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7126  hypothetical protein  31.01 
 
 		 367 aa  179  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1157  bacterial luciferase family protein  30.06 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0999  luciferase  30.4 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00760  putative enzyme  29.09 
 
 		 362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1128  monooxygenase of the alternative pyrimidine degradation pathway  30.51 
 
 		 360 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3982  luciferase family protein  30.68 
 
 		 354 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.29 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.83738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2624  alkanesulfonate monooxygenase  28.53 
 
 		 386 aa  150  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3199  bacterial luciferase family protein  27.3 
 
 		 397 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6112  Luciferase-like monooxygenase  27.65 
 
 		 384 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5432  luciferase-like  33.73 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2411  hypothetical protein  28.57 
 
 		 387 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3065  luciferase  26.29 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0528805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3289  putative luciferase-like monooxygenase  31.66 
 
 		 353 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.177074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0815  luciferase family protein  27.41 
 
 		 376 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2811  putative luciferase-like monooxygenase  27.61 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4323  alkanesulfonate monooxygenase  26.16 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4260  luciferase family protein  30.54 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4409  alkanesulfonate monooxygenase  26.16 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4272  luciferase family protein  29.62 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  24.23 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1371  Alkanesulfonate monooxygenase  26.37 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1580  Alkanesulfonate monooxygenase  26.9 
 
 		 370 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  23.68 
 
 		 367 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  23.68 
 
 		 367 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  23.96 
 
 		 367 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  23.96 
 
 		 367 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  24.86 
 
 		 364 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  23.96 
 
 		 367 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 367 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  26.46 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  24.19 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  24.86 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  23.68 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  25.21 
 
 		 425 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7083  flavin-dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  25.21 
 
 		 364 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  24.65 
 
 		 369 aa  109  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  25.21 
 
 		 364 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0532  alkanesulfonate monooxygenase  25.34 
 
 		 403 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  23.9 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4860  alkanesulfonate monooxygenase  24.33 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166271  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  24.93 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0148  putative luciferase-like monooxygenase  28.69 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  0.8985 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4703  alkanesulfonate monooxygenase  31.58 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.460596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1240  luciferase-like  33.94 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6592  luciferase family protein  33.94 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6196  luciferase family protein  33.94 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4334  luciferase family protein  24.45 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.905772 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  27.89 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  25.14 
 
 		 362 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  23.27 
 
 		 364 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  24.79 
 
 		 364 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  23.82 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  25.95 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1067  luciferase family protein  29.03 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  23.97 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  25.95 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7216  monooxygenase  29.13 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.310211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4299  putative alkanesulfonate monooxygenase (FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase)  25.58 
 
 		 366 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0448772  hitchhiker  0.00193589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  24.1 
 
 		 366 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  24.73 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3993  Alkanesulfonate monooxygenase  26.18 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210249  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1784  luciferase-like protein  30.28 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00435599  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02320  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_6G01920)  24.63 
 
 		 486 aa  95.5  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3477  Alkanesulfonate monooxygenase  35.26 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1497  alkanesulfonate monooxygenase  25.14 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  26.49 
 
 		 454 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5009  Luciferase-like monooxygenase  23.19 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0791237  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02460  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.4 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1560  FMNH2-dependent monooxygenase  25.07 
 
 		 461 aa  94  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3950  Luciferase-like monooxygenase  25.97 
 
 		 370 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1259  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.19 
 
 		 460 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860986  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6573  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases-like protein  27.19 
 
 		 460 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265801  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  28.9 
 
 		 389 aa  92.8  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31500  Flavin-dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 463 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>