More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0997 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0997  cytochrome P450  100 
 
 
400 aa  824    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148456  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  31.87 
 
 
399 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  32.39 
 
 
399 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  33.33 
 
 
398 aa  203  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  30.15 
 
 
407 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  33.42 
 
 
399 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  32.46 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  30.42 
 
 
418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  31.58 
 
 
406 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  29.97 
 
 
412 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  31.62 
 
 
406 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1768  cytochrome P450  30.65 
 
 
405 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  30.55 
 
 
415 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  30.63 
 
 
390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  32.03 
 
 
388 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1964  cytochrome P450  28.64 
 
 
421 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.512147  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  30.38 
 
 
401 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  30.05 
 
 
392 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  30.03 
 
 
403 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  30.87 
 
 
421 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  30.75 
 
 
399 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  27.25 
 
 
461 aa  159  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  31.06 
 
 
402 aa  159  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  30.73 
 
 
418 aa  159  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  32.04 
 
 
399 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  30.53 
 
 
402 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  34.75 
 
 
412 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  28.94 
 
 
414 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  29.3 
 
 
399 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  29.52 
 
 
396 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  30.92 
 
 
406 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  30.73 
 
 
405 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  30.68 
 
 
404 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  34.68 
 
 
398 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  28.22 
 
 
411 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  30.41 
 
 
404 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  30.41 
 
 
404 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  28.94 
 
 
414 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  31.21 
 
 
402 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  29.34 
 
 
405 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  27.58 
 
 
447 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  29.34 
 
 
405 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  28.82 
 
 
410 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  30.49 
 
 
400 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  29.82 
 
 
397 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  30.18 
 
 
407 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  29.28 
 
 
398 aa  150  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  28.04 
 
 
405 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  28.98 
 
 
408 aa  149  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1259  cytochrome P450  28.92 
 
 
448 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922035  hitchhiker  0.00766496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  28.68 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  31.68 
 
 
417 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  30.73 
 
 
407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  34.23 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  30.73 
 
 
407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  28.21 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  28.34 
 
 
422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  29.1 
 
 
405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  31.94 
 
 
417 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  31.05 
 
 
436 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  32.76 
 
 
415 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  30.03 
 
 
418 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  31.27 
 
 
401 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  28.91 
 
 
408 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  26.7 
 
 
410 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  28.8 
 
 
419 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1764  cytochrome P450  28.98 
 
 
418 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  29.27 
 
 
425 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1782  cytochrome P450  28.98 
 
 
418 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1829  cytochrome P450  28.98 
 
 
418 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  29.95 
 
 
393 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4880  cytochrome P450  28.19 
 
 
450 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7683  cytochrome P450 hydroxylase  27.7 
 
 
405 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  29.55 
 
 
390 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  34.36 
 
 
405 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  30.81 
 
 
435 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  30.81 
 
 
435 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1854  cytochrome P450  28.64 
 
 
449 aa  143  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  30.9 
 
 
400 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  29.7 
 
 
393 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  27.48 
 
 
407 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  28.91 
 
 
403 aa  142  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2007  cytochrome P450  26.99 
 
 
404 aa  142  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  27.81 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  28.39 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  30.43 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  30.56 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  33.33 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  30.82 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  29.01 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  30.85 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  29.01 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  29.01 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  32.12 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12295  cytochrome P450 128 cyp128  28.54 
 
 
489 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  29.54 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  31.79 
 
 
345 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0332  cytochrome P450  29.5 
 
 
425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0342  cytochrome P450  29.5 
 
 
425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.241654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  31.37 
 
 
409 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>