More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0973 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0973  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
396 aa  828    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0971663  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0966  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.67 
 
 
397 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0374518  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  34.2 
 
 
414 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2976  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.83 
 
 
419 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478644  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.33 
 
 
423 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.55 
 
 
425 aa  219  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3717  Rieske (2Fe-2S) region  32.06 
 
 
425 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.126427  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.11 
 
 
423 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3730  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.06 
 
 
425 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3790  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.06 
 
 
425 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.144005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.04 
 
 
421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4184  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.19 
 
 
423 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.2 
 
 
430 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.08 
 
 
409 aa  210  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136632  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.83 
 
 
429 aa  206  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.665588  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3376  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.3 
 
 
429 aa  206  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151153  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4357  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.81 
 
 
422 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3723  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.61 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3710  Rieske (2Fe-2S) region  29.06 
 
 
425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3783  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.06 
 
 
425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0573009  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3683  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.98 
 
 
419 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804885  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4213  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.12 
 
 
444 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3747  Rieske (2Fe-2S) region  31.39 
 
 
440 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00627634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3820  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.39 
 
 
440 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365881  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3759  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.14 
 
 
440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0223979  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2439  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.24 
 
 
449 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6914  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.83 
 
 
431 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3276  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.83 
 
 
436 aa  156  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.32 
 
 
406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0324  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.52 
 
 
442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.68 
 
 
392 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.27 
 
 
390 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.88 
 
 
455 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4787  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.98 
 
 
471 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.819616  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4406  Rieske (2Fe-2S) region  34.98 
 
 
471 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3695  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.65 
 
 
460 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036835  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4493  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.98 
 
 
471 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.940392  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  30.6 
 
 
393 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  32.43 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.43 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.17 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2328  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.88 
 
 
456 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459675  normal  0.238108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  27.11 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1680  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.44 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  hitchhiker  0.000101719 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.98 
 
 
432 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.64 
 
 
384 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.41 
 
 
385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.48 
 
 
383 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58359  predicted protein  32.65 
 
 
218 aa  113  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00818873  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.62 
 
 
362 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.84 
 
 
394 aa  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.98 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2455  Rieske (2Fe-2S) protein  27.54 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.22 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  30.67 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.16 
 
 
447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102143  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  26.25 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08656  Rieske 2Fe-2S family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06450)  32 
 
 
431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1788  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.18 
 
 
470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.78 
 
 
362 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
383 aa  109  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0119557  normal  0.0397341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0074  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.72 
 
 
396 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.5 
 
 
457 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  29.05 
 
 
387 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
376 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.73 
 
 
384 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  31.84 
 
 
434 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001292  phenylpropionate dioxygenase and related ring-hydroxylating dioxygenases large terminal subunit  31.4 
 
 
395 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.99509  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2476  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.2 
 
 
419 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.75426 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  30.96 
 
 
393 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4043  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.05 
 
 
419 aa  106  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  0.202366 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3539  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.77 
 
 
448 aa  106  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  24.85 
 
 
380 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  25.74 
 
 
403 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.7 
 
 
423 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3748  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.05 
 
 
419 aa  106  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.219388 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  30.41 
 
 
445 aa  106  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2271  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.9 
 
 
443 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  0.774548 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3776  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  31.87 
 
 
429 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4003  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.51 
 
 
419 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.11239  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1416  Rieske 2Fe-2S family protein  31.68 
 
 
405 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1461  Rieske 2Fe-2S family protein  31.68 
 
 
405 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1889  Rieske (2Fe-2S) protein  25.94 
 
 
420 aa  103  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.099621  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.13 
 
 
427 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2069  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.16 
 
 
413 aa  102  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4897  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.24 
 
 
410 aa  103  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.71235 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3534  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.37 
 
 
473 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.79 
 
 
268 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37570  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  27.67 
 
 
424 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.925134  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.98 
 
 
430 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.78 
 
 
414 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.44 
 
 
430 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2461  Rieske (2Fe-2S) region  27.58 
 
 
385 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.197522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.85 
 
 
430 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0597  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.54 
 
 
414 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0052075  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2506  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.58 
 
 
385 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3553  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
413 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.19 
 
 
385 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0242656  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1712  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.69 
 
 
415 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>