55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3370 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 268 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2976  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  91.79 
 
 		 419 aa  528  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73.76 
 
 		 425 aa  427  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3730  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  71.59 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  71.69 
 
 		 423 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478644  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3717  Rieske (2Fe-2S) region  71.59 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.126427  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3790  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  71.59 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.144005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  69.78 
 
 		 421 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.67 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3683  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  54.1 
 
 		 419 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  54.24 
 
 		 423 aa  300  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.22 
 
 		 429 aa  299  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.665588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4357  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.53 
 
 		 422 aa  298  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3376  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.03 
 
 		 429 aa  298  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4184  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.57 
 
 		 423 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3759  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.92 
 
 		 440 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0223979  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.03 
 
 		 430 aa  285  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3747  Rieske (2Fe-2S) region  50.92 
 
 		 440 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00627634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3820  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.92 
 
 		 440 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4213  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.55 
 
 		 444 aa  284  8e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3723  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.01 
 
 		 425 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3710  Rieske (2Fe-2S) region  51.65 
 
 		 425 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3783  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.65 
 
 		 425 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0573009  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2439  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.26 
 
 		 449 aa  279  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3276  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.23 
 
 		 436 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6914  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.23 
 
 		 431 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.46 
 
 		 409 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0966  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.18 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0374518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  29.96 
 
 		 414 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0973  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.52 
 
 		 396 aa  98.6  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0971663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3505  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  21.7 
 
 		 449 aa  55.8  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0908  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.28 
 
 		 441 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.17 
 
 		 406 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.67 
 
 		 455 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  38.67 
 
 		 455 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.16 
 
 		 469 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.67 
 
 		 455 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2328  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.16 
 
 		 456 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459675  normal  0.238108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2260  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.14 
 
 		 448 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0324  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.37 
 
 		 442 aa  46.6  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3044  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.12 
 
 		 369 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000332714 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 362 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.94 
 
 		 362 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.08 
 
 		 340 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6872  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.99 
 
 		 452 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3695  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.73 
 
 		 460 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3536  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.94 
 
 		 444 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2261  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32 
 
 		 451 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.08 
 
 		 430 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1468  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.25 
 
 		 413 aa  43.5  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  31.08 
 
 		 410 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2348  putative aromatic dioxygenase, large subunit  29.21 
 
 		 424 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  31.08 
 
 		 432 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3484  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.94 
 
 		 469 aa  42.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>