More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2439 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2439  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
449 aa  939    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3759  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  84.56 
 
 
440 aa  777    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0223979  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4213  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  80.44 
 
 
444 aa  768    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3747  Rieske (2Fe-2S) region  84.79 
 
 
440 aa  781    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00627634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3820  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  84.79 
 
 
440 aa  781    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365881  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  67.62 
 
 
423 aa  619  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4357  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.83 
 
 
422 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3683  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.88 
 
 
419 aa  568  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804885  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  56.74 
 
 
425 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3730  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  55.45 
 
 
425 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3717  Rieske (2Fe-2S) region  55.45 
 
 
425 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.126427  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3790  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  55.45 
 
 
425 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.144005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  56.03 
 
 
423 aa  498  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  55.82 
 
 
421 aa  498  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  56.29 
 
 
423 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478644  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2976  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.95 
 
 
419 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.77 
 
 
429 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.665588  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3376  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.3 
 
 
429 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151153  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3723  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.71 
 
 
425 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3710  Rieske (2Fe-2S) region  48.71 
 
 
425 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3783  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.71 
 
 
425 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0573009  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.26 
 
 
430 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4184  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.78 
 
 
423 aa  405  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3276  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.52 
 
 
436 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6914  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.52 
 
 
431 aa  330  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.26 
 
 
268 aa  280  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.58 
 
 
409 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136632  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0966  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.98 
 
 
397 aa  199  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0374518  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  30.6 
 
 
414 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0973  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.01 
 
 
396 aa  163  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0971663  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3695  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.16 
 
 
460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036835  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.87 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.54 
 
 
362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.02 
 
 
362 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2328  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.84 
 
 
456 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459675  normal  0.238108 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  37.23 
 
 
387 aa  124  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  35.41 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.27 
 
 
469 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  29.54 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.99 
 
 
432 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.38 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.27 
 
 
455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4787  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.74 
 
 
471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.819616  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4406  Rieske (2Fe-2S) region  30.74 
 
 
471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4493  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.74 
 
 
471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.940392  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.62 
 
 
340 aa  116  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  32.74 
 
 
455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.74 
 
 
455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0198  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0908  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.91 
 
 
441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.242613  normal  0.0404177 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.51 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  31.88 
 
 
380 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.82 
 
 
387 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.39 
 
 
430 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2685  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  33.33 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.16 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.93 
 
 
457 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.12 
 
 
430 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  31.79 
 
 
387 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1788  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.02 
 
 
470 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.7 
 
 
427 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  30.95 
 
 
434 aa  109  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.12 
 
 
430 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.68 
 
 
385 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.7 
 
 
427 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.7 
 
 
427 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.28 
 
 
430 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  28.7 
 
 
382 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.15 
 
 
424 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0911716  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1680  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.57 
 
 
355 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  hitchhiker  0.000101719 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.82 
 
 
448 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1988  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.84 
 
 
470 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.26 
 
 
427 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  32.12 
 
 
430 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  34.02 
 
 
445 aa  107  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2496  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  30.26 
 
 
427 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124288  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3539  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.85 
 
 
448 aa  106  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0324  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.28 
 
 
442 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.47 
 
 
374 aa  106  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  31.47 
 
 
374 aa  106  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.28 
 
 
373 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.71 
 
 
403 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.47 
 
 
374 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  31.47 
 
 
374 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.47 
 
 
374 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.12 
 
 
427 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0478  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.63 
 
 
413 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  31.47 
 
 
374 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.19 
 
 
427 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0999  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.63 
 
 
422 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.63 
 
 
422 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.917605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.47 
 
 
374 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.47 
 
 
374 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  31.47 
 
 
374 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0763  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.5 
 
 
360 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.63 
 
 
422 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0635134  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.72 
 
 
390 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3901  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.42 
 
 
459 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.682799  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1416  Rieske 2Fe-2S family protein  32.99 
 
 
405 aa  104  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>