More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_58359 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_58359  predicted protein  100 
 
 
218 aa  459  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00818873  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08656  Rieske 2Fe-2S family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06450)  43.81 
 
 
431 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10836  iron-sulfur cluster-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03920)  41.86 
 
 
445 aa  168  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.198378 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06756  conserved hypothetical protein  47.66 
 
 
177 aa  144  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.7 
 
 
340 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  35.53 
 
 
373 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.8 
 
 
384 aa  121  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  33.33 
 
 
380 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1680  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.84 
 
 
355 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  hitchhiker  0.000101719 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.63 
 
 
374 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.63 
 
 
374 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.63 
 
 
374 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6020  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.84 
 
 
382 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.31 
 
 
373 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  34.43 
 
 
382 aa  112  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.28 
 
 
374 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0973  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.65 
 
 
396 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0971663  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  31.28 
 
 
374 aa  112  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  32.81 
 
 
376 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  31.28 
 
 
374 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  31.28 
 
 
374 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.28 
 
 
374 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.28 
 
 
374 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.28 
 
 
374 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  31.28 
 
 
374 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.28 
 
 
374 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.57 
 
 
423 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252321  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4738  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.18 
 
 
377 aa  109  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.590157  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4698  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.85 
 
 
377 aa  109  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.412068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0763  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.44 
 
 
360 aa  108  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4363  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.49 
 
 
487 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000470921  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.95 
 
 
362 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.56 
 
 
362 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2853  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.61 
 
 
420 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  30.66 
 
 
387 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.67 
 
 
384 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0932  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.12 
 
 
418 aa  101  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556495  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.21 
 
 
376 aa  101  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.71 
 
 
358 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3553  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.73 
 
 
413 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0890  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  36.64 
 
 
497 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145074  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2069  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.53 
 
 
413 aa  99.8  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.8 
 
 
430 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  26.82 
 
 
432 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  27.15 
 
 
430 aa  99  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1595  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.1 
 
 
483 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1622  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.1 
 
 
484 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0299575  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2476  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.69 
 
 
419 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.75426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1647  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.1 
 
 
484 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0463  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.72 
 
 
484 aa  99  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.328369  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.27 
 
 
430 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0595  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.1 
 
 
483 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2685  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  33.33 
 
 
444 aa  98.2  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.27 
 
 
430 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.78 
 
 
418 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3019  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.16 
 
 
387 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.866348 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5070  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.05 
 
 
437 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192805  hitchhiker  0.00646968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0685  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.17 
 
 
484 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0578  Rieske (2Fe-2S) protein  30.21 
 
 
413 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1196  Rieske (2Fe-2S) protein  31.38 
 
 
401 aa  96.3  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  28.87 
 
 
445 aa  96.3  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2115  iron-sulphur Rieske protein  29.69 
 
 
413 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.36 
 
 
430 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5207  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.21 
 
 
413 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114331  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5015  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.69 
 
 
413 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277088  normal  0.658452 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3290  Rieske (2Fe-2S) region  30.21 
 
 
413 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0747  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.69 
 
 
422 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0835  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.69 
 
 
422 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  29.68 
 
 
434 aa  95.9  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.69 
 
 
413 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400487  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5078  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.21 
 
 
413 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27977  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1189  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.84 
 
 
450 aa  95.9  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0478  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.69 
 
 
413 aa  95.5  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.69 
 
 
422 aa  95.5  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.917605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0999  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.69 
 
 
422 aa  95.5  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.69 
 
 
422 aa  95.5  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0635134  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  26.04 
 
 
414 aa  95.1  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_003296  RS02037  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  29.17 
 
 
414 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4220  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.95 
 
 
467 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  26.54 
 
 
429 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3714  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.9 
 
 
434 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.162257  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4897  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.6 
 
 
410 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.71235 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1861  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.17 
 
 
413 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523473  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.5 
 
 
385 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.51 
 
 
383 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.47 
 
 
394 aa  93.2  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.575491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.69 
 
 
455 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  29.69 
 
 
455 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.69 
 
 
455 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1801  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29 
 
 
401 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195025  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  26.56 
 
 
410 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  31.41 
 
 
387 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3219  Rieske (2Fe-2S) region  29.17 
 
 
408 aa  92.4  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201195  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0549  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.37 
 
 
414 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.369608  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.8 
 
 
387 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4815  Rieske (2Fe-2S) region  28.12 
 
 
413 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4043  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.65 
 
 
419 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  0.202366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1578  iron-sulphur Rieske protein  28.65 
 
 
437 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  26.07 
 
 
429 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3748  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.65 
 
 
419 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.219388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>