More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32390 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 199 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  70.97 
 
 		 189 aa  285  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  63.78 
 
 		 209 aa  254  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  63.1 
 
 		 201 aa  251  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  64.13 
 
 		 197 aa  248  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  62.9 
 
 		 198 aa  248  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  69.19 
 
 		 206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  59.07 
 
 		 195 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  59.38 
 
 		 213 aa  231  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  56.83 
 
 		 213 aa  224  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  58.73 
 
 		 194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  55.85 
 
 		 196 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  56.32 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  60.54 
 
 		 196 aa  218  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  60.42 
 
 		 195 aa  217  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  58.85 
 
 		 202 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  55.85 
 
 		 192 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  55.85 
 
 		 192 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  55.85 
 
 		 192 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  54.26 
 
 		 192 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  56.91 
 
 		 192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3987  peptidyl-tRNA hydrolase  61.5 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  57.59 
 
 		 198 aa  202  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  58.6 
 
 		 196 aa  202  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  58.6 
 
 		 196 aa  202  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  59.57 
 
 		 195 aa  200  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  57.98 
 
 		 194 aa  198  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  57.84 
 
 		 191 aa  194  7e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  49.75 
 
 		 205 aa  193  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  54.5 
 
 		 191 aa  191  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  53.4 
 
 		 199 aa  191  8e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 185 aa  181  8.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  55.73 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0884  peptidyl-tRNA hydrolase  53.27 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.202868 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  55.44 
 
 		 202 aa  178  4.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  52.43 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  47.28 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  55.26 
 
 		 204 aa  168  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  44.86 
 
 		 217 aa  161  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 199 aa  159  4e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  45.83 
 
 		 195 aa  158  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  45.9 
 
 		 204 aa  158  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  47.03 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 		 186 aa  154  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 207 aa  154  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 202 aa  154  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  42.37 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  39.44 
 
 		 205 aa  152  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  46.49 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  45.66 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 199 aa  151  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 		 190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  47.4 
 
 		 196 aa  150  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  45.95 
 
 		 192 aa  151  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  45.95 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  47.13 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  45.95 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  44.68 
 
 		 192 aa  150  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  44.77 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  41.86 
 
 		 193 aa  150  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  45.61 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.83 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.99 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 185 aa  148  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 		 190 aa  147  7e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  44.44 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  47.51 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 		 184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.58 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  46.55 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 232 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  46.96 
 
 		 225 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0123  peptidyl-tRNA hydrolase  46.49 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391018  normal  0.213165 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 188 aa  145  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 		 186 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>